Els conflictes al voltant de la titularitat de les càtedres de filosofia, entre tomistes i suaristes, dominics els uns, jesuïtes els altres, venia de lluny i es va polititzar quan el Consell de Cent va donar suport als primers i la nova monarquia, als segons. Només hi va faltar que els estudiants de la universitat s’enfrontessin a pedrades amb els del Col·legi de Nobles de Cordelles, jesuïtes i majoritàriament botiflers.