La limitación más importante de GPT es que solo se puede usar en equipos con firmware UEFI y con sistemas operativos Windows 10, 8, 7, Vista y Server de 64 bits, las distribuciones GNU/Linux ya se están adaptando, aunque muchas aún no son compatibles. Esto significa que si tu equipo tiene un firmware BIOS te será imposible utilizar GPT y tendrás que conformarte don MBR, lo mismo pasa si usas un sistema operativo no compatible.