A serotonina (5-HT) modula diferentes atividades neuronais, como controle de impulsos, agressividade e tendências suicidas. Desta forma, diminuição da liberação e da atividade da 5- HT podem estar associadas a tentativas de suicídio, agressividade e distúrbios do sono. A participação da 5-HT na fisiopatologia do TAB, a hipótese permissiva, na qual um déficit na neurotransmissão serotoninérgica central permitiria a expressão tanto da fase maníaca, quanto da depressiva; contudo, tais fases difeririam em relação aos níveis de catecolaminas (noradrenalina e dopamina) centrais, que estariam elevadas na mania e diminuídas na depressão. Foi demonstrada diminuição dos níveis de ácido 5 hidroxiindolacético (5-HIAA), principal metabólito da serotonina, tanto a mania quanto a depressão estão associados a uma redução na função serotoninérgica central. Constatou níveis significativamente menores de 5- HIAA no córtex frontal e parietal.