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Ecosystème (êtres vivants dans leur milieu), Mutualisme: avantage d'…

- - - - Formation: dans les régions tempérés, en forêts, le sol est plus siliceux --> si pas de cultures, horizon O = humus, l'horizon A accumule de la MO, il est plus ou moins lessivé, dans l'horizon B on a une altération avec libération de Fe (minéraux silicates) puis par hydrolyse, on obtient un sol acide de type Mull et horizon C avec l'altération de la roche mère = zone de transition
      - Recyclage de la matière
        
        Humification: décomposition de la MO contenue dans la partie superficielle du sol/ formation d'humus avec acides humiques, présence de microorganismes saprophage et phytophage, les ensembles de tissus morts forment un stock de MO/ décomposeurs = source de nourriture pour les consommateurs secondaires
        
        Minéralisation de la MO: transformation de la MO en éléments minéraux par la respiration, les bactéries dégrade les NH4+ puis nitrification (NH4+ -> NO2-), nitratation (NO2- --> NO3-), fermentation
        
        Formation des combustibles fossiles: La partie de la MO qui n'est pas recyclée participe à la formation de combustibles fossiles par enfouissement dans les sédiments. En milieu continental = charbon dans les marécages ou dans les océans = HydroC (huile+gaz)
      - Structuration
        
        Verticale : plusieurs strates : flore souterraine et microflore les 20 premiers cm = hypogée + faune d'abord aérobie puis anaérobie/ strate herbacée = alimentation des consommateurs primaires + source d'azote/strate muscinale (lichens + mousses) dans les quelques m/ strate arbustive (2 à 7m)/ strate arborée (8 m)/ strate canopée ==> connexions entre les strates
        
        Horizontale: diversité des niches écologiques (litière/ arbres...), diversité des métabolismes aérobie, anaérobie, besoin de lumière ou non
    - - Forêts naturelles: biodiverse et résistante, au stade de maturité des EV = équilibre. on a une structure verticale (aérienne et souterraine). Exemple: hêtraie caractérisée par la hauteur des arbres, densité et polarisation vers le haut, les organismes qui y vivent profitent de la couverture thermique en été, en hiver pas de feuilles = installation des bulbes de Jacinthe. la diversité des classes d'âges, hauteurs, diversité des essences repoussent les pathogènes
      - Forêts artificielles: monospécifique et fragile : ouragans du Limousin en 1999 = repeuplement avec des résineux = acidification des sols par uniformisation des apports et exports de matière
  - - - Généralités: N2 est très stable, sa scission est catalysée par Ferrédoxine/azote réductase/ nitrogénase utilisation de l'ATP pour former du NH3. Les bactéries libres peuvent faire cette réduction mais seul les bactéries symbiontes le font en quantité suffisante
      - 1/ Conversion de N2 en NH3 ou NH4 = ammonification par la nitrogénase--> permet la formation de composés organiques --> libération sous forme NH4+ dans le sol et disponible pour les autres organismes 2/ Nitrification: il faut un sol chaud et pH 7 qui permet l'oxygénation rapide des NH4+ par les bactéries nitrifiantes: d'abord oxydation en nitrites (NO2- par Nitrosomas) puis en nitrates (NO3- par Nitrobacter) 3/ Dénitrification --> réduction de NO3- en NO2, NO, N2 par des bactéries anaérobies (Pseudonomas) qui utilisent l'ion nitrate comme accepteur d'électrons pendant la respiration
    - - Court: temps inférieur au siècle = conversion du CO2 en carbone organique par la PS et inverse par la respiration/fermentation
      - Long: processus géologique qui intervient, enfouissement de la MO dans les sédiments, transformation en combustibles, réservoirs et temps longs
    - - Déforestation: acidification des sols, augmentation de l'effet de serre, moins de niches écologiques
      - Pollution : augmentation de l'acidité des océans, effet de serre, hausse du niveau marin par fonte des glaces
  - - - Production brute: quantité de matière organique fabriquée à chaque niveau trophique (t/an) ==> primaire = quantité de MO fabriquée par les producteurs primaires / secondaire = consommateurs de chaque rang
      - Production nette: quantité de MO fabriquée et incorporée par l'organisme = production brute - quantité de matière perdue par métabolisme (respiration)
    - - Chaine trophique: suite d'organismes où chacun constitue un maillon de la chaine, mange celui qui lui précède ==> producteur primaire autotrophe et les consommateurs sont hétérotrophes
      - Réseau trophique: ensemble des chaines trophiques d'un écosystème (relation buissonnante ==> consommateurs polyphages) ==> apparition du niveau trophique: ensemble des organismes de l'écosystème qui obtiennent leur énergie à partir du même étage alimentaire
    - - des biomasses: surface proportionnelle à la biomasse des individus présents à chaque niveau
      - des énergies: surface proportionnelle à l'énergie de production présente à chaque niveau
      - des nombres: surface du rectangle proportionnel au nombre d'individus à chaque niveau
    - - Nitrification = respiration à donneur minéral: nitritation (NH4+ --> NO2- par Nitrosomonas) et nitratation (NO2- --> NO3- par Nitrobacter)
      - Fermentation: oxydation incomplète de la Mo en absence d'O2 et couplage direct avec la glycolyse pour produire de l'énergie
      - Par respiration mitochondriale = respiration à donneur organique: molécules simples --> glycolyse + bêta oxydation des acides gras jusqu'au cycle de Krebs ==> CO2 et NH4+ ==> tous les organismes respirent sont des décomposeurs donc participent à la minéralisation
    - - Résistance: aptitude à résister aux changements et à maintenir intacte sa structure et son fonctionnement ==> importante au voisinage du climax car système fermé
      - Résilience: aptitude à récupérer sa structure et son fonctionnement après une perturbation ==> importante au stade pionnier car le biotope et la biocénose sont moins complexes (faible diversité et peu d'interactions interspécifiques) :checkered_flag: chêne de la Ste Baume
  - - - Intraspécifiques: relations entre individus d'une espèce ==> reproduction, soins des jeunes, vie sociale, compétition (lutte pour un partenaire et ressources) :checkered_flag: cerf
      - Interspécifiques: relations entre individus d'espèces différentes
        
        Symbiose: association obligatoire entre deux organismes à bénéfice réciproque :checkered_flag: lichens / mycorhizes
        
        Mutualisme: association non obligatoire à bénéfice réciproque :checkered_flag: pollinisation
        
        Association à 3 partenaires : orchidée dépourvue de chlorophylle + mycorhizes + plantes chlorophylliennes ==> théorie du tricheur parasite ou symbionte?
        
        Commensalisme: exploitation d'une espèce par une autre sans dommage ni bénéfice pour l'espèce exploitée :checkered_flag: phorésie = transport d'un individu par une autre espèce
        
        Compétition: individus nécessitant les mêmes ressources limitées :checkered_flag: écureuil VS oiseau pour pomme de pain / myxomatose lapin VS Homme pour les ressources agricoles
        
        Prédation : prédateur se nourrit de proies :checkered_flag: carnivore et herbivore / herbivore et végétaux
        
        Parasitisme: parasite se nourrit au dépend de son hôte pouvant aller jusqu'à le tuer :checkered_flag: Homme et paludisme
    - - Fraction microbienne: aérobie, anaérobie, esp veg au dessus, pH du sol, conditions physico-chimiques
      - Distribution des espèces: zones géographiques selon le climat (température, humidité) et l'altitude (hauteur ou profondeur) ==> niche écologique
    - - Niche écologique: positions trophiques, habitationnelles, relationnelles,...d'un organisme dans l'écosystème ==> elle dépend des interactions inter et intraspécifiques qui exercent une pression de sélection et restreignent la niche potentielle à réalisée. Dépend de l'utilisation des ressources biotiques et abiotiques du milieu. => elles structurent les communautés, et permettent d'identifier une espèce/ équilibre dépend des ressources et de l'espace
        
        Spéciation Pinçons
      - Théorie neutraliste: mutations génétiques échappent à la sélection naturelle et se diffusent indépendamment des celles-ci dans les populations (n'affectent pas les prot et leurs fonctions car soit touche de l'ADN non codant soit mutation silencieuse) ==> ni avantage ni désavantage sélectif + transmission de ces mutations au hasard ==> explique une partie de la diversité génétique