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VIRO : Assemblage et Libération → ← Pathologie et Épidémie virale -…
VIRO : Assemblage et Libération →
← Pathologie et Épidémie virale
Site de production
Virus à ADN
Assemblage nucléaire avec NLS (exception de
Poxviridae
Réplication dans un mini noyau viral
Virus à ARNsb +
Prod sur RE
Invagination du RE pour la Dengue
Prot virales impliquées dans réplication
ARNsb -
Corps d'inclusion :concentration de prot virales et ARN viraux pour production virale (exception pour la grippe)
Corps Negri dans neurones infectés par la rage
Construction nucléocapside
Auto assemblage permet la prod de VLPs
Picornaviridae
:
VP4+2+3+1 → clivage par protéase 3C → VP0(VP4+VP2), VP3, VP1 → maturation → VP4, VP2, VP3, VP1
Assemblage autour d'échaffaudage de prot virale
Assemblage autour de l'acide nucléique : capside hélicoïdale. Présence d'une séquence d'empaquetage phi et d'autres séquences spécifiques. Pas d'interactions directes entre ADNv et prot de capside
VIH : séquence phi fixée par la prot de nucléocapside virale. Positionnement dans le génome évite d'empaqueter des ARNm épissés
Adénovirus
: L4 et IVa2 fixent les séquences phi
SV40 : Sp1 fixe ADN viral et prot VP2/VP3
Empaquetage peut se faire sans séquence phi, cas de
Flaviviridae
Génome ségmenté
Structure régulière des segments NC
Pas de particules virales avec + de 8 segments
Libération des particules nues
1) Lyse cellulaire (ADP, L3 pour
Adenovirus
)
2) Sécrétion des particules (détournement de l'autophagie pour polio)
Différents mécanismes de bourgeonnements
I : interaction entre glycoprot d'enveloppe et capside (
Alphavirus
)
II : prot de matrice ou capside (
rétrovirus
)
III : glycoprot d'enveloppe (VHB)
IV : prot de matrice essentielles mais d'autres prot augmentent l'efficacité (
Rhabdoviridae
,
Orthomyxoviridae
)
Domaines L
Recrutent prot cellulaires ncssaires pour la libération de particules virales bourgeonnées
Motifs PTAP/PSAP, LYPxnL et PPxY
VIH1recrute domaine p6 de Gag avec P/P et LYPxnL
HTLV1 recrute MA de Gag avec P/P et PPxY
Ebola recrute VP40 avec P/P et PPxY
VSV recrute MA avec P/P et PPxY
Recrutement ESCRT = Endosomal Sorting Complexes Required for Transport
Libération particules enveloppées
Influenza : bourgeonnement au pôle apical. HA, NA, M2 ciblées vers membrane apical. ARN, NP, M1, PA, PB1, PB2 s'associent dans noyau, exportés vers cyt
VIH1 : bourgeonnement au site de ontact entre LT infecté et CPA
Maturation particules virales après formation
Clivage protéolytique
VIH1 : pro clive Gag en MA-NA-NC et Pol en Pro-RT-lnt
Adénovirus
: protéase L3 clive les 6 prot virales à l'intérieur de la particule
Clivage glycolytique
Influenza : NA enlève acides sialiques de la srface de la particule virale
Infection virale
Sites
Muqueuse : gastro intestinale (oral), respiratoire (inhalation), génitale (sexuelle)
Peau (rare) : entrée via abrasion, vecteurs souvent (moustiques, tiques)
Sang (majeur) : transfu, drogues injectables, greffes
Mère-enfant : in utero, périnatal, allaitement
Déroulement
Infection localisée : réplication sur site initial, incubation courte (< 1 semaine) (ex : pap)
Infection généralisée : organe cible, distinct du site d'infection, virémie sanguine, période d'incubation moyenne (1à3semaines) ou longue (> 3 semaines) (ex : VIH, varicelle)
Progression
Réplication→symptômes→fin pathologie car réponse immunitaire freine réplication et réponse humorale défend à long terme (+/- récurent, + pour grippe car plusieurs sérotypes différents et - pour varicelle)
Réplication→symptômes→mort (ebola)
Entre les 2 (grippe, covid19)
Réplication→symptômes(primo infection)→retour des mois ou années après (
herpesvirus
)
Réplication active et aggravation symptômes plus tard→mort (VIH)
Neutralisation
Ac neutralisant : empêche attachement viral au R ou co R cellulaire. Empêche déploiement des domaines de fusion impliqués dans entrée. Prévient des infections( IgA+IgE avec muqueuses)
Polio : R se fixe sur AA de la polio dans crevasse alors que Ac se fixe sur bosse donc n'empêche pas intéraction → pas neutralisant
Grippe : Ac neutralisant se fixe sur AA du virus qui vont muter sans modifier la fixation du R ce qui explique le retour de la grippe
• ex : Grippe espagnole (zoonose, oiseau), origine occidentale sur base militaire américaine. Surveillance avec vaccination Homme et oiseaux
Sérologie et culture cellulaire (TCID50 donne titre neutralisant)
Zoonose : le plus souvent chauve souris car vit en grande communauté et sont résistantes à des pathogènes grave pour l'Homme
Exemples
Polio
Symptômes
Méningites : fièvre, vomissement
Paralysie flasque : membres inférieurs puis remonte, parfois jusqu'au diaphragme, respiration impossible donc mort
Mineurs : malaise, fatigue
Sérotype I le + néfaste
Vaccin : injectable (virus inactif) ou oral (virus atténué) qui permet immunité des muqueuses
Coronavirus
Sous famille :
Torovorinae
et
Coronaviridae
alpha, beta (mamm.), gamma, delta (oiseaux)
• Fixation prot S sur R cellulaire (plusieurs différents)
• Prot M : assemblage et bourgeonnement
• Prot E : forme sphérique et libération de la particule
• Prot N : fixation ARNg viral
ARNsb + (IV), nucléocapside hélicoïdale
alpha → Population à risques : enfants<2ans, personnes âgées, immunodéprimés
Beta → covid 19