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miRNA e siRNA (biogenesi (miRNA (trascritti dall'RNA pol II a partire…
miRNA e siRNA
biogenesi
miRNA
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sono coinvolti in molte malattie. l'inespressione di un miRNA porta ad un'espression eccessiva del gene target. Un'eccessiva espressione del miRNA porta all'espressione ridotta del gene target.
siRNA
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possono essere endogeni o esogeni. La funzione principale è quella di rispondere alle minacce esterne reprimendo l'espressione genica dell' "invasore"
di solito derivano dalla stessa regione su cui agiscono (a differenza dei miRNA che derivano da una regione diversa)
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Drosha, Dicer e RISC
Drosha
riconosce i pri-mRNA dalla struttura secondaria, dalla dimensione e dalle sequenze che fiancheggiano la forcina
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RISC
attività elicasica, endo ed esonucleasica e lega l'RNA
formato da diverse proteine tra cui quelle della famiglia Ago (argonauta) di cui si conosce bene solo la Ago2. Questa presenta a partire dall'NH2: N, PAZ, MID e PIWI.
3' del miRNA è legato a PAZ, la parte centrale a MID e la parte terminale al 5' a PIWI. Quando interagisce con l'mRNA a formare il complesso ternario le basi vengono esposte (prima non lo sono)
anche nel caso dell'appaiamento non perfetto, ci deve essere appaiamento perfetto con la seed region che è lunga 2-5 nt nell'estremità 5' del miRNA
Dicer
possiede 4 domini funzionali:
- dominio elicasico ATP dipendente
- dominio PAZ
- due domini RNasi III in tandem
- dominio che lega l'RNA