ยุงลายที่มีเชื้อ Zika virus ที่เกิดจากเชื้อ Flavivirus ไปกัดคนทั่วไปหรือหญิงตั้งครรภ์ โดยเชื้อจะใช้เวลาฟักตัวประมาณ 4-7 วันหลังจากที่โดนยุงลายกัด ซึ่งเชื้อจะแพร่เข้าสู่ร่างกายทางกระแสเลือด โดยการเพิ่มจำนวนของเชื้อไวรัสผ่านกระบวนการ translation ในเซลล์ที่มี receptor ต่อเชื้อนั้น เช่น fibroblast และ dentritic cells หลังจากที่เซลล์ทำการเพิ่มจำนวนเชื้อมากขึ้น ส่งผลให้เซลล์นั้นตายและปล่อยเชื้อไวรัสออกมาผ่านทางกระแสเลือดไปสู่เซลล์อื่นๆในร่างกาย ทำให้เกิดอาการและอาการแสดงออกมา ส่วนการติดเชื้อในหญิงตั้งครรภ์ เชื้อจะสามารถแพร่กระจายผ่านทางรกไปสู่ทารกในครรภ์ได้
เมื่อทารกในครรภ์มีการติดเชื้อไวรัส Zika ไวรัสจะเพิ่มจำนวนขึ้นภายในเซลล์ประสาท โดยมี target ที่เซลล์ neural progenitor cells ทำให้เซลล์ประสาทตั้งต้นถูกทำลาย จึงไม่มีการเพิ่มจำนวน (neuronal proliferation) การเคลื่อนย้าย (migration)และ การพัฒนาเปลี่ยนแปลง (diffentiation) ของเซลล์ประสาท" ส่งผลต่อการเจริญเติบโตของเซลล์สมอง ทำให้ทารกที่ติดเชื้อเกิดความพิการแต่กำเนิด ทั้งก้านสมอง การได้ยิน การมองเห็น พัฒนาการและสติปัญญา