У підслизовій оболонці дванадцятипалої кишки залягають кінцеві секреторні відділи дуоденальних залоз. За будовою це складні розгалужені трубчасті залози зі слизово-білковим секретом. Секрет залоз містить слиз, який володіє лужною реакцією, нейтралізує шлунковий сік, захищає слизову оболонку кишки від його шкідливої дії. Ферменти, які є секреторним продуктом дуоденальних залоз, перетворюють трипсиноген у трипсин (ентерокіназа), розщеплюють дипептиди до амінокислот (дипептидази) та вуглеводи (амілаза). Вивідні протоки дуоденальних залоз відкриваються біля основи крипт або між сусідніми ворсинками.