Малая церковь, как называют этот храм в народе, появилась благодаря усердию и стараниям Ивана Баташева в конце ХVIII века «между слободами Верхнего и Среднего заводов, на пригорке, осеняемом берёзами и по скату его соснами». Создание храма связывают с расположенным здесь большим кладбищем, которое было уничтожено в середине ХХ векаВид храма ХVIII века отличался от современного: не было тогда помещения трапезной, к западу от церкви располагалось одноэтажное деревянное здание богадельни. В таком виде он существовал до середины XIX века.
Церковь Иоанна Богослова считается образцом классицизма с чертами неоготики, сейчас это крестообразное однокупольное здание с трапезной и колокольней, пристроенными в 1857 году, что было вызвано желанием сделать его более вместительным.