La entidad financiera nace en 1908 como “La Filantrópica”, nombre inicial de Filanbanco. Fue fundada por Francisco García Avilés con el propósito social de fomentar el ahorro en los pobladores para que pudieran mejorar y realizar sus sueños. Fue considerado el mejor banco por varios años a partir desde los años 60. El banco, que se llamaba La Filantrópica, fue adquirido en 1960 por el Grupo Isaías, quienes decidieron cambiar su nombre por Filanbanco en 1976, con inyección de capital, lo hicieron con el propósito de dotar a la ciudad Guayaquil de una institución bancaria que mirara, sobre todo, la expansión del sector comercial y agrícola de la Región Litoral, que tenía auges con la exportación de varios productos como el banano y el cacao.