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突变克隆性的确定方法 (单区域单时间点 (克隆性推断 (阈值 (CCF (CCF累积概率, CCF 95%置信区间,, CCF(Nmut)大小),…
突变克隆性的确定方法
单区域单时间点
克隆性推断
阈值
CCF
CCF累积概率
CCF 95%置信区间,
CCF(Nmut)大小
VAF:Sanger测序极限(非实体瘤)
聚类
基于CCF采用狄利克雷过程聚类
CCF计算
假设Nchr为任意整数
基于假设确定Nchr,再计算CCF
同时遍历Nchr和CCF,确定CCF
Nchr等可能性
Nchr可能性不等
遍历CCF,平等看待Nchr各种可能性,基于不同Nchr累积概率确定CCF
假设Nchr = 1
多区域多时间点及单细胞
(待补充)