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突变克隆性的确定方法 (单区域单时间点 (基于CCF的克隆性推断 (CCF的计算 (假设Nchr = 1, 估计Nchr值), CCF推断克隆性…
突变克隆性的确定方法
单区域单时间点
基于VAF的克隆性推断
直接使用VAF阈值判定
基于CCF的克隆性推断
CCF的计算
假设Nchr = 1
估计Nchr值
CCF推断克隆性
CCF阈值
CCF置信区间
CCF累积概率
CCF大小
CCF聚类
基于CCF值聚类
多区域多时间点
(暂未考虑)
取样来源
基础测度
分类
VAF = pCCF / (CPNnorm(1-p) +pCPNmut)