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Procesamiento RNA (5' capping (Funciones (Protege mRNA de nucleasas,…

- - - - ESE/ISE: favorecen
      - ESS/ISS: evitan
    - - Activadores: se unen a ESE
      - Represores: no dominio RS (solo block)
  - - - Marcas histonas
      - Reclutamiento factores splicing
      - Posicionamiento nucleosomal
      - Sec. DNA: ricas AT
      - Prot.: CTCF
- - - - Genes euk. de orgánuclos y proc.
      - = mec. pre-mRNA
      - Maq.: ribozimas
    - - GU...AG
      - AU...AC
      - 2 transesterificaciones
      - Spliceosomas mayores y menores
      - Sitio de ramificación con A
    - - 2 transesterificaciones con sitios de G
      - Maq. = grupo II
      - rRNA nuclear, genes orgánulos, pocos euk.
  - - - Acoplamiento a transc.: splicing directo
      - Sec. que ↑/↓ probabilidad splicing
    - - A del branching site ataque nucleófilo a la G de entre intrón-exón
      - Loop
      - 3'OH de exón ataca a G del otro exón
      - Fusión exones, liberación intrón
    - - Ribonucloprot.
        
        1 snRNA: sec. complementaria a sitios splicing
        
        20 prot.: función estructural, splicing y ensamblaje
      - Complejo estable: interacciones prot.-prot., prot.-snRNA y snRNA-RNA
      - Tipos snRNA: U1, U2, U4, U5, U6
      - Funciones
        
        Reconocer sitio 5' splicing y sitio de lazo
        
        Acercar los sitio para Rx
        
        Rotura y unión RNA por RNA help de prot. (ATP)
      - Ensamblaje
        
        U2 unión por especificidad de snRNA: complejo A
        
        Sale BBP: extrusión A: ataque
        
        BBP reocnoce branch site: permite unión U2AF
        
        Complejo trimérico B: U4+U6 estabilizado por U5
        
        U1 reconoce sitio unión 5'
        
        Sale U2AF
        
        Complejo B acerca zonas branching
        
        U1 y U4 (bloquea catálisis U6) salen
        
        U6 corta: complejo B'
        
        U5 une extremos exones
        
        Libera intrón: complejo C
        
        AU...AC
        
        Reconoce a la vez sitios 5' y 3'
        
        U1. U2 = U11, U12
    - - Se unen a sec. esp. exones
      - Exones + peq. que intrones
      - Regulan
        
        Especificidad
        
        Eficiencia
        
        Splicing alternativo
      - Tejido esp. para diferenciar isoformas
      - Identificar exones y reclutar maq.
- - - - C/D: metilación
      - H/ACA: pseudouridinación
      - Modificación 2'OH ribosa