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Regulación transc. euk. (FT (Reclutan remod. crom. (Marcas de histonas…
Regulación transc. euk.
FT
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≠ dominios reconocimiento: bHLH, HD, HMG, HTH, LZ, ZF
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Regulación: fosforilación, secuestro, dimerización
Reclutan remod. crom.
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Marcas de histonas
Enhancer
Inactivo: H3K9me2/3, DNAme, H3K27me3
Activo: H3K4me1/2, H3K27ac, H2A.Z
Gen
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Activo: H3K36me3, H3K79me3
Represión gran escala
Estable: H3K9me2/3, LADs, DNAme, LOCKs
Transitoria: H3K27me3, Pc bodies
Promotor
Poised: H3K4me3, H3K27me3, H2A.Z
Activo: H3K4me2/3, acetilación, H2A.Z
Inactivo: H3K27me3, H3K9me3, DNAme
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Marcas leídas por dominios esp. que pueden leer, añadir y quitar
Coactivadores: writers, erasers, readers
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Expresión depende de
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Elementos en trans: prot. (activador/represor, coactivador/correpresor, remod. crom.) o RNA (microRNA, lncRNA)
Marcas epigenéticas: DNA, histonas
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Elementos en cis: enhancer, islas CpG, insulator, silenciador
Enhancers
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TADs
Grupos de genes con sus enhancers, en loop
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Heterocrom.
Constitutiva, facultativa, LADs o LOCKs
Establecida por
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Islas CpG
≠ loca., pueden estar met.
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DNMT1 (mant.), DNMT3A, DNMTB (de novo)
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Regula expresión en diferenciación, silenciamiento sec. rep., función estructural, silenciamiento prom.
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Marcas comienzan represión, a l/p met.
Crom. compacta, no transc., definida por marcas histonas y met
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