Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
Transcripción procariotas (Características (Cadenas (Molde: se transcribe,…
Transcripción procariotas
Características
pol toma pausas y se detiene
Puede dar macha atrás y quitar nt
más lento que replicación
No todo el DNA se transcribe
5'-3'
No necesita primer
Un solo tipo de pol
RNA pol se une al promotor, y empieza a transcribir en el +1
Cadenas
Molde: se transcribe
Codificante: = sec. que mRNA
RNA pol
ω: chaperona y reguladora
β': subunidad catalítica
Mg2+ en el c.a. y otro para unión nt
β+β': c.a.
Dímeros α: ensamblan las β, regulan con el CDT
Factor σ: especificidad
Características
No reconoce promotores
Canal principal: DNA
Puede unir dsDNA
Canal secundario: entran dNTPs
↑ afinidad por DNA
Canal salida: RNA
c.c. con Mg2+
Modulación
Factor σ
pol+factor = holoenz.
Se libera tras iniciación
↑ afinidad pol por promotor
Familias
σ54: estrés ambiental, activadores y ATP
σ70: regula grueso genes transc., no activadores ni ATP
Regulación
Transcripcional
Factores anti-σ: secuestran o degradan
Secuencia DNA
FT
Moléculas desestabilizan
Detección
ChIP
ChIP-Seq
Footprinting
Bandshift
Iniciación
Complejo binario cerrado: pol+σ+dsDNA
Complejo abierto: rotura de -10 a +3
Promotor
Elemento -35: por σ
Elemento extendido: por σ
UP-element: por CTD
TATA (-10): por σ
Proceso
Se abre la cadena: burbuja
ssDNA pasa a canal activo --> incorpora 2nt
pol+σ se unen a promotor
pol engloba 35bp de ssDNA
iniciación abortiva: σ se libera
Iniciación abortiva
Se para o se suelta
Transcribe 8nt
Elongación
Act. nucleasa: quita 1nt
Genera mRNA
Error: cadena se despega un poco del molde: para
Puede corregir errores
Terminación
Intrínseca
Rica G-C
A-U + débil: favorece pausa
Sec. DNA: estructuras 2ª: para pol
Extrínseca
Regiones Rut: ricas C pobre G: no estructura 2ª
Rho reconoce Rut
Dependiente factor Rho
Rho se mueve hacia 3' desplazando molde: disociación
FT
De represión simple
Loops
Represor activador
Impedimentos estéricos
Co-dependencia
Contactos independientes
Unión cooperativa
Reposicionamiento
Anti-represión
De activación simple
Clase II
Diana superpuesta con -35
Contacto con β dominio 4
Cambio conformacional
Contacto con σ
Cambia conformación diana para que pol interaccione con -10/-35
Clase I
Diana UP -35
Recluta pol por interacción directa con CTD