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Organización material genético (Histonas (Estructura (Nucleosoma (Colas…
Organización material genético
Procariotas
Dominios de compactación independientes --> aisla propagación --> loops fijados en la base
Bacterias
DNA superenrollado libre
Se transmite a todo el dominio
Tensión torsional --> relax por topo.
DNA supernerollado no libre
Prot. mantienen estructura 3D
E de interacción estabiliza --> no tensión
Negativo (almacena E libre)
Nucleoide --> DNA + prot.
Niveles organización
Nucleosoma
Hélice de nucleosomas --> fibra 30nm
Núcleo de histonas y doble hélice
Cromatina
De interfase vs. mitótico
Eucromatina
Cambia la compactación en mitosis (interfase - compac.)
Dispersa por el núcleo
Genes activos transcr.
Heterocromatina
Mucha compac. ~ cromosoma mitosis
Periferia nuclear y nucleolo
Tipos
Constitutiva --> telómeros, regiones repetidas
Facultativa --> genes transc. shhh
Histonas
Extremos
H4
3 y 9h por debajo
H2A
5 y 7h por encima
H3
1 y 11h entre cadenas
H2B
4 y 8h entre cadenas
Ensamblaje
H2A-H2B heterodímeros
Tetrámero H3-H4 une DNA (centro surco menor)
Curva el DNA
Recluta dos dímeros H2A-H2B (flanqueantes)
H3-H4 heterodímeros
Se asocian a tetrámeros
Estructura
Histone fold domain
3 alpha-helix --> dímeros y tetrámeros
Heterodímeros head-to-tails --> unión N-t+C-t
(+) Arg, Lys --> compensa (-) DNA P
H2A y H2B dímeros
H3 y H4 tetrámeros
Hélice dextro. toroidal a izq (superenro. -)
Nucleosoma
Colas hacia exterior
Simétrico
Core (DNA+histonas)+DNA linker
H1
Se une a DNA linker
Protege de digestión
Para compactación
Canónicas
Replication core histones
Chaperonas
ASF, CAF1 (PCNA) --> H3.1, H3.2, H4
NAP1 (reclicla), FACT --> H2A, H2B
H3.1, H3.2, H4, H2A, H2B
Nuevos nucleosomas --> aleatorios pool+nuevos
No canónicas
No replicación --> transc., reparación, mantenimiento...
Chaperonas
HIRA (gaps)
H3.3 (mantenimiento heterocromatina)
DAXX/ATRX
H3.3., H2A.Z, H2AX...
Modificaciones post-traduccionales colas
Erasers
Readers
Writers
Posicionamiento --> orden
Remodeladores cromatina
FT
Secuencia
preIC y elongación
Ocupación --> cantidad
Tratar con DNasaI y MNasa
Compactación fibra 30nm
Solenoide
Zig-zag
Mayor compactación
Estocástico
Extrusión
SMC, topo.