RNAs reguladores
snRNAs
siRNAs
piRNAs
miRNAs
lncRNAs
Categorías
Nuclear
Procesamiento canónico y no canónico
Estructura de horquilla
Hebra guía y passenger ( ❌ en procesamiento)
Regulan genes endógenos por pol II
Cortados por endonuc.: Drosha, Dicer...
Asociarse a familia Argonaute: asociadas a complejo represión/degradación RISC
Familia AGO
PIWI: línea germinal
Wago: gusanos
AGO: ubicua
Complementariedad
Exacta: degrada
Parcial: no trad.
Transcritos por pol II
Especificidad por nt 2-7
Unión parcial en 3'UTR
Procesamiento
Biosíntesis
miRNAs
Rutas no canónicas
CAP
PoliA
Tailoring
Editing
Corte en base horquilla
Transporte a cito.
Tailoring y editing
Corte del loop
Separación cadenas
Mec. represión
Directo de transc. sin procesamiento por Drosha
Directo por splicing y debranching
Mediante clivaje
Drosha endonuc., reconoce dsRNA
DGCR8 estabiliza: corta mejor
Microprocessor (Drosha+DCGR8)
pre-miRNA se une a exporting factor
Regulación por Drosh
Grupo I y II editing
Grupo II tailoring
Tailoring: TUT añade U --> procesar normal
Corte por los overhangs 3' y 5': deja 2nt overhang
TRBP ↑ fidelidad corte Dicer, puente Dicer-AGO
Dicer endonuc. procesa pre-miRNA
AGO separa cadena manteniendo la guía
Complejo miRISC maduro se une a mRNA
Complementariedad
Competir por CAP
Impedir ensamblaje ribo.
Corte donde se juntan las ssRNA y en loop
Deja overhang en 3'
Editing: A en inosina por adenosina deaminasa; pueden metilarse
Regulado por cofactores
Perfecta: AGO corte central: degradado por exonuc.
No perfecta: une cofactores como GW182
Deanilación: ↓ poliA
Impide círculo trad.
Degradar
siRNAs
AGO se une y separa cadenas
Se une a RISC: siRISC
Procesamiento por Dicer: corta: deja overhangs
Se puede amplificar por RdRp
Cadena guía y passenger (❌)
Apareamiento silencia
A partir de dsRNAs
Complementariedad
Total: degradación
Heterocrom. al reclutar modificadores de histonas
Parcial: ~miRNA en trad.
Defensa contra virus, transposones y transgenes
Por pol II
Cito.
No codifican prot.
Funciones
Dp de transc.: solo transc. hace función
Dp de producto de transc.: cis y trans
No funcionales
Plataforma de reclutamiento
Cambios confomacionales cromosomas
Compartimentalización nuclear
Tejido esp.
Marca de histona H3K27ac
Backsplicing: RNA circulares
Esponja miRNAs
Unir a mRNA
Trans
Cis
eRNA y loops: transc. por Mediator
Silenciamiento, imprinting
Inhibición otros mRNA
Scaffold
Reclutar remod. crom.
Cebos para prot.
Señal
Guía