RNAs reguladores

snRNAs

siRNAs

piRNAs

miRNAs

lncRNAs

Categorías

Nuclear

Procesamiento canónico y no canónico

Estructura de horquilla

Hebra guía y passenger ( ❌ en procesamiento)

Regulan genes endógenos por pol II

Cortados por endonuc.: Drosha, Dicer...

Asociarse a familia Argonaute: asociadas a complejo represión/degradación RISC

Familia AGO

PIWI: línea germinal

Wago: gusanos

AGO: ubicua

Complementariedad

Exacta: degrada

Parcial: no trad.

Transcritos por pol II

Especificidad por nt 2-7

Unión parcial en 3'UTR

Procesamiento

Biosíntesis

miRNAs

Rutas no canónicas

CAP

PoliA

Tailoring

Editing

Corte en base horquilla

Transporte a cito.

Tailoring y editing

Corte del loop

Separación cadenas

Mec. represión

Directo de transc. sin procesamiento por Drosha

Directo por splicing y debranching

Mediante clivaje

Drosha endonuc., reconoce dsRNA

DGCR8 estabiliza: corta mejor

Microprocessor (Drosha+DCGR8)

pre-miRNA se une a exporting factor

Regulación por Drosh

Grupo I y II editing

Grupo II tailoring

Tailoring: TUT añade U --> procesar normal

Corte por los overhangs 3' y 5': deja 2nt overhang

TRBP ↑ fidelidad corte Dicer, puente Dicer-AGO

Dicer endonuc. procesa pre-miRNA

AGO separa cadena manteniendo la guía

Complejo miRISC maduro se une a mRNA

Complementariedad

Competir por CAP

Impedir ensamblaje ribo.

Corte donde se juntan las ssRNA y en loop

Deja overhang en 3'

Editing: A en inosina por adenosina deaminasa; pueden metilarse

Regulado por cofactores

Perfecta: AGO corte central: degradado por exonuc.

No perfecta: une cofactores como GW182

Deanilación: ↓ poliA

Impide círculo trad.

Degradar

siRNAs

AGO se une y separa cadenas

Se une a RISC: siRISC

Procesamiento por Dicer: corta: deja overhangs

Se puede amplificar por RdRp

Cadena guía y passenger (❌)

Apareamiento silencia

A partir de dsRNAs

Complementariedad

Total: degradación

Heterocrom. al reclutar modificadores de histonas

Parcial: ~miRNA en trad.

Defensa contra virus, transposones y transgenes

Por pol II

Cito.

No codifican prot.

Funciones

Dp de transc.: solo transc. hace función

Dp de producto de transc.: cis y trans

No funcionales

Plataforma de reclutamiento

Cambios confomacionales cromosomas

Compartimentalización nuclear

Tejido esp.

Marca de histona H3K27ac

Backsplicing: RNA circulares

Esponja miRNAs

Unir a mRNA

Trans

Cis

eRNA y loops: transc. por Mediator

Silenciamiento, imprinting

Inhibición otros mRNA

Scaffold

Reclutar remod. crom.

Cebos para prot.

Señal

Guía