El pronóstico en cuanto a tolerancia clínica es favorable en la mayoría de lactantes y niños pequeños con hipersensibilidad inmediata a proteínas de leche de vaca, consiguiendo la tolerancia clínica de las proteínas de leche de vaca el 28-56% al año de edad, el 60-77% a los dos años, el 71-87% a los tres años y el 90% a los seis años10. Si a los cinco años no han conseguido la tolerancia a la leche de vaca, son muy pocos los que van a lograrla de forma espontánea. La APLV es, en muchos casos, la evidencia de una predisposición genética que se va a expresar en el futuro con nuevas enfermedades alérgicas. Se ha observado que aproximadamente la mitad de los niños con APLV desarrollan alergia a otros alimentos y hasta un 28% alergia a inhalantes antes de los tres años de edad.