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课题的核心问题或价值??? (当前TME相关signature marker的关系模式(I级) (b. 关系模式是否具有癌症特异性和免疫治疗方式特异…
课题的核心问题或价值???
- 当前TME相关signature marker的关系模式(I级)
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- 整合多种signature marker成一个新signature(I级) score :star:
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感知结果:
炎性中IFNG18、IS、GEP、IFNG6、CYT、PD1、gene.CD8、TcellInfiltrationScore中信息几乎一致,完全可以由某个来替代,如GEP;但CTLA4、IMPRES、PDL1、APM、CIBERSOFT.CD8携带着部分特异的信息
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- 整合多种应答机制类型预测子,建立一个更为普适(robust)的marker
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这里可能两个问题:
- 代码验证时,只能验证一部分预测子。部分预测子可能没有在这两套数据中使用,或没有被评估过预测价值
- 基于TPM计算预测子得分结果确实原文差异很大
- 比较定量水平差异时,我们不是比较相同格式的数据,而是不同格式数据,这其中混杂了参考转录组、定量工具、定量方式差异等多种因素 --- 这个问题可能比较敏感