При такой системе финансовых органов мы имеем организационный разрыв между такими направлениями финансовой деятельности государства, как формирование государственных денежных фондов и их распределение. Получается, что вопросами государственных доходов занимается одно ведомство (Министерстве государственных доходов), а расходами - другое Министерство финансов. Между тем, доходные и расходные отношения – это отношения единого финансово-экономического института, расчленение которых приводит к распаду самого этого института
При таком организационном устройстве в деятельности различных ведомств неизбежно начинают преобладать узковедомственные интересы, что приводит к межотраслевым конфликтам и бюрократическим проволочкам в решении финансовых вопросов.