С Бабырганом связана множество легенд. По одной из них была у старика Алтая дочь Катунь, влюбленная в молодого пастуха Бия. И вот однажды ночью Катунь убежала к любимому. На утро разгневанный старый Алтай послал ей вдогонку своих богатырей, чтобы поймать и воротить беглянку. Один за другим они погибали в пути, образуя пороги, а красавица Катунь, бушуя и пенясь, бежала все дальше, пока не встретилась со своим любимым. Обнявшись, они навечно потекли вместе, образовав могучую сибирскую реку Обь. Дальше всех преследователей ушел самый могучий богатырь Бабырган. Он настиг Катунь, когда она уже выбегала из гор на равнину, но не смог он удержать беглянку, вырвалась Катунь и потекла дальше, а Бабырган остался стоять каменной громадой - последней горой Северного Алтая.