Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
:check: Сделать простую реализацию для подбора K (Тесты :check: (Сделать…
:check: Сделать простую реализацию для подбора K
Посмотреть на старую логику :check:
Сделать подбор K для разных длин ридов :check:
При просмотре всех primary библиотек выбирать max вмето min :check:
Пробросить dataset_data :check:
выписать ignory_types :check:
Тесты :check:
Сделать тесты, что если есть длинные риды и короткие primery риды, то выбирается максимум из двух и отрабатывает не падая. :check:
Проверить, что подбираются только в multicell mode, а в single cell и meta нет. :check:
Сделать теста на проверку fastq и прочих форматов. Что со всеми ок :check:
Выписать все вариантов ридов :check:
Сконвентировать во все эти форматы. Как-то их получить. :check:
Тест, самые pe, но со всеми вариантами ридов
Если риды маленького размера, то отрабатывает и не падает :check:
Сгенерировать короткие парные риды :check:
Нужен какой-то не multicell режим. например, single cell :check:
Проверка,на какие библиотеки смотрим, а на какие нет. :check:
Не смотрим на merge риды тест есть в другом разделе :check:
Если есть какая-та не праймари библиотека, то на нее не смотрим :check:
Смотрим на primary :check:
Посмотреть как сделано для РНК и переосмыслить :check:
Что-то сделать с тем, что при мелкой длине ридов запускается слишком большое K и ошибка. :check: