Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
Сделать pipeline для запуска и подсчета FDR :check: (Перезапустить…
Сделать pipeline для запуска и подсчета FDR :check:
Перезапустить sandpuma на сокращеном датасете. :check:
Отфильтравать датасет только по правильным парам :check:
Составить список answer по тому, что разметил Леша :check:
Найти место, на котором оставновились и на котором не посчитано. :check:
почистить папку :check:
Модифицировать скрипт, что бы он не пересчитывал на уже посчитаном. :check:
Скрипт который считает FDR :check:
Настроить систему папок, что бы это все перезапускать было как-то прям удобно.
Принимает на вход ответы и результаты и что-то рисует в jupyter
Сохранить set пар, с правильными ответами
Сохранить dict из id в peptide
Для подсчета FDR необходимо получить список со score и 0 если верный и 1 если неправильный.
Из res вытащить score и пары id
По списку понять кто верный, а кто нет.
Нужен dict в id
Нужен set верных пар.
for dataset 1,2,3.
Get list by res.csv (Возвращает список score и wrong/right)
Сделать три датасета для PNP :check: