Please enable JavaScript.

Coggle requires JavaScript to display documents.

Собрать сетку, которая предсказывает консервативность по последовательности

- - - - получить выравнивания фрагментов на все рассматриваемые геномы
      - определить позиции, в которых больше t замен как не консервативные
    - - выбрать не уникальные фрагменты
        
        выбрать такие фрагменты
        эталонной последовательности,
        для которых есть больше k находок
        в других геномах
        
        написать pypeline,
        принимающий на
        вход параметры k, s, t
      - подобрать k
      - отфильтровать ошибки секвенирования
        
        ввести параметр s --
        число mismatch или gap,
        которое мы допускаем в
        качестве ошибки
        секвенирования и не учитываем
      - выбрать эталонный геном