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modificazione degli Istoni (modificazioni (acetilazione -> l'…
modificazione degli Istoni
tipi di enzimi che intervengono nella modificazione degli stoni
erasers -> enzimi che rimuovono le modificazioni
readers -> proteine con domini in grado di leggere queste modificazioni
writers -> che modificano I residui delle code istoniche
modificazioni
ubiquitinazione -> dipendentemente a quale residuo di lisina viene monoubiquitinato (dalla proteina monoubuitina), potrà essere associata a silenziamento o espressione genica
sumoilazione -> le proteine sumo hanno sia un ruolo nell'attivazione che nello spegnimento che nell'attenuazione della trascrizione
citrullinazione -> l'arginina viene modificata in maniera irreversibile (spegne definitivamente alcuni geni)
ADP- ribosilazione -> conferisce carica negativa ai residui favorendo la repulsione fra proteine e DNA
acetilazione -> l'acetilazione neutralizza la carica positiva e rende più debole l'interazione fra DNA e istoni portando ad un rilassamento della cromatina
HDCA (decetilasi)
HAT (acetiltranferasi)
modificazione dei residui dopo la traduzione e la produzione degli istoni nel citoplasma (fondamentale nel processo di incorporazione degli istoni durante il passaggio della forca replicativa)
modificazione dei residui di lisina sulla cromatina
metilazione -> dipendenetemte da quale residuo dell'enzima viene mutilato vengono reclutate diverse proteine che possono silenziare o attivare un particolare gene (esistono anche enzimi demetilasi)
funzioni
distribuzione di diverse modificazioni lungo un gene per garantire la sua trascrizione o il suo silenziamento
sinergia fra fattori di trascrizione che attivano l'espressione di un determinato gene
possono essere sia presenti marker di cromatina attiva che marker di cromatina silenziata nella stessa regione -> cromatina bivalente (cromosoma X)
comunicazione fra modificazioni (alcune modificazioni possono impedire ad enzimi di modificare altri residui delle code istoniche
importanti per il processo di duplicazione (ubiquitinazione dell'istone H2 da parte di BRE1 che porta ad interazione con MCM , complesso importante per l'assemblamento della forca)
possono svolgere un ruolo importante nella riparazione del DNA e la replicazione (quindi non solo per l'espressione genica )
nel caso in cui il DNA venga danneggiato le modificazioni portano ad un arresto del ciclo cellulare e favorire l'accesso ai complessi di riparazione
la lisina 4 trimetilata può interagire con MCM e favorire così la replicazione
modelli del codice istonico
modello dei readers -> le modificazioni possono reclutare ed essere lette dai readers che modulano la trascrizione.
modello diretto -> interazioni elettrostatiche fra DNA e fattori di rimodernamento della cromatina
proteine coinvolte
possono modificare e leggere le modificazioni (attraverso diversi domini)
HP1
cromodominio : riconosce la lisina 9 trimetilata
cromoshadow domain: recluta altre proteine (è in grado di formare dimeri )