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(IL NUCLEO (Ed è implicato in ml processi (4_Sede di sintesi dell'RNA…

- - - - I cluster di geni per rRNA sono loc al'esterno vicino ai centromeri quindi in una regione silenziata
  - - - unaDensa fibrilla
      - Componente Granulare dove troviamo i Ribosomi pre-assemblati verso l'esterno
      - Regione fibrillare centrale (fattori impo x espressione dei geni ribosomiali/ RnaPol1)
    - - Possono essere ereditati come tali
      - o possono disorganizzarsi in Mitosi
      - per poi Ricomporsi ed essere mantenuti nelle cellule figlie
    - - da una parte è un sito altamente attivo forte attività trascrizionale ( trascrizione Rna rib)
      - e dall'altra questa regione PeriNucleolare funzione di inattivare cromosoma X e per regolare le regioni PeriCentriche
  - - - Viene trascritto ed espresso da quelle regioni Intergenihe
      - Il silenziamento :
        
        Il primo step è l'espressione di un Rna
        
        Successivamente viene processato
        
        Solo questa sequenza che in realtà è omologa al 5' del gene per il 45S
        
        E' importante perchè viene reclutato da NORC che garantisce l'associazione di TIP5 al promotore
        
        quando arriva causa una modificazione dell'eterocromatina = silenziamento
        
        le modifiche sono : HDAC / Deacetilasi / DNAmetiltranferasi/ Istonmetiltranf
        
        ci sono 2 inibitori = TSA inibisce HDAC e AZA-DC inibisce le metilasi
      - Creano questa specificità di legame di TIP5 nella regione del promotore
    - - dalla Metilazione nella Citosina in posizione -133 -143 garantita da NORC
      - Questo impedisce il legame con UBF e di permettere la trascrizione
      - il silenziamento è importanti per rendere questi geni stabili, limitando i processi di ricombinazione tra tutti questi geni ( meccanismo conservazione)
  - - - Complesso rimodellamento cromatina)
        
        Funzione =
        
        Silenzia le coppie di geni
        
        Compattando al cromatina
        
        Reclutando DNAmetilTransferasi
        
        andando a Deacetilare gli istoni
        
        attivando le Iston-Metil-Transferasi sui promotori dei geni per gli rRna rib
        
        Funziona da Scaffold = richiama gli enzimi per il silenziamento
        
        Genera uno Spostamento del promotore per il fattore che regola l'espressione dei geni per RNArib (non più legame con UBF)
        
        Responsabile della replicazione tardiva dei geni silenziati
      - Funzione
        
        Serve a modulare il silenziamento dei geni per gli rRna /CromosomaX / Cromatina Pericentrica
        
        TIP5 Si associa a CenpA (assemblaggio dei centromeri) mentre PARP1 mantiene il silenziamento dei telomeri
      - Caratterizzato dal Complesso TIP5 Complex
        
        Recluta DnaMetiTransferasi
        
        le HDAC che vanno ad impedire UBF(UpStream binding factor) di accedere al DNA e di trascrivere i geni ribosomiali
        
        interagisce con TTF1
  - - - Topo = 12-15-16-18-19
      - e in altri cromosomi acrocentrici
      - NOR = sono sequenze dove sono organizzati in cluster i geni per RnaRib
        
        13 / 14/ 15/ 21 e 22 ( loc sul braccio p)
        
        Fondamentali per formare il Nucleolo
- - - - 1_ In ogni cellula femminile uno dei 2 cromosomi X è inAttivo
      - 2_ Questa inAttivazione avviene nelle prime fase dello sviluppo embrionale
      - 3_ L'inattivazione era random (o di origine paterna o X materno ) e questo può essere ereditato
  - - - Perchè nel caso dell Y è molto più piccolo, e quindi il fatto di avere 2 X si ha 100mB in più di DNA rispetto al maschio
  - - - A livello di cromatina/ Organizzazione di 3D nel nucleo / il riposizionamento nel nucleo/ Shift nel taiming di replicazione
  - - - e un Silenziamento imprinting per quanto riguarda il Trofoectoderma
      - Fecondazione
        
        stadio di 2 cellule ci troviamo con entrambi gli X , quello paterno Riattivato, quello materno è sempre stato attivo
        
        A 4 cell abbiamo un imprinting (silenziamento del X paterno )
        
        Il trofoectoderma quello paterno continua a rimanere Inattivato (silenziamento Imprinting)
        
        questo è random nell'uomo(avviene prima nel trofo e poiMCI)
        
        Durate lo sviluppo embrionale, avete tra i 5.5 e 7.5 avete in maniera random l'InAttivazione o di origine materna o paterna
        
        E quelle che derivano da queste continueranno a conservare l'Inattivazione (o pat o Mat)
        
        2° RIATTIVAZIONE
        
        Passando dalla Morula alla Blastocisti c'è la 2° Riattivazione del X paterno e questo accade soltanto nella MCI
        
        3° RIATTIVAZIONE
        
        Nelle cellule germinali
        
        1°RIATTIVAZIONE
      - Silenziamento Random per quanto riguarda l'embrione
        
        Il cromosoma X di origine paterna viene silenziato e resta tale
- - - - perchè si manifesta la pato in cui uno dei 2 cromosomi X è silenziato ?
      - in realtà è una pato che colpisce diversi organi e tessuti: bassa statura, prob cardiaci
      - Questo X che viene Inattivato tutto sommato tanto Inattivato non lo è se quando manca completamente abbiamo fenotipo di questo tipo
      - questo è perché alcuni geni del cromosoma X che va in contro a silenziamento in realtà sfuggono al silenziamento e rimangono cmq espressi
        
        E' suff che sia espresso per il 10 % dell'attività che ha nel normale cromX attivo per essere considerato un gene che sfugge al silenziamento
  - - - Dove in realtà ci sono diversi geni che sfuggono al silenziamento e che sono comunque espressi.
    - - Altri non sono in cluster ma potrebbero essere distribuiti in altri punto del cromosoma
      - Alcuni si trovano in queste regioni e possono andare in contro a riti di ricombinazione tra X e Y e sono in una particolare regione
  - - - Formazione di un Loop (dove abbiamo es_ insulator/ctcf) a questo punto potete avere la demetilazione di un promotore, la lisina4TriMetilata o Acetilazione dell'istone H4 (eucromatina )
        
        che favorisce l'espressione di questo gene
      - Mentre nei geni che trovate in gran parte del X inattivo troviamo
        
        Cpg metilata / trimetilata lisina 9 e 27/ altri complessi compattano la cromatina
        
        questi geni che fuggono è grazie ad una organizzazione 3D della cromatina
      - quindi si parla di organizzazione della cromatina non solo modificazioni epigenetiche della cromatina ma anche organizzazione 3 D che favorisce l'espressione
  - - - Regione dove sono loc geni che codificano per diversi NonLRna responsabili della regolazione del silenziamento
      - Hanno studiato tale regione 100Kb e tramite delezioni hanno individuato la struttura minima che basta per inAttivare
        
        qui troviamo tutti questi geni qua: in mezzo abbiamo Xist nel antisenso t6 e altri NonCodiRna
    - - Centro di partenza dell'inattivazione del X completo
    - - regione fondamentale per avvicinamento dei 2 X prima della scelta di uno dei 2
    - - Composto da diverse ripetizioni,
        
        importanti per reclutare PRC2 e nelle diverse fasi del silenziamento
      - Ripit-A
        
        Non solo è parte di Xist
        
        sono ripetizioni ricche in A
        
        sono anche trascritte in un RnaNon codificante più piccolo = Rep A
        
        ruolo nell'inizio del silenziamento
      - Regolata sia dai NonCod Rna e Rnf12
      - C importanti
        
        buinging per la cromatina
      - Descrivere Network che regola espressione di Xist
        
        Fattori della Pluripotenza = fattori di trascrizione garantiscono la pluripotenza (semic, chela,oct4)
        
        inibiscono l'espressioen XIST
        
        La rete di regolazione che agisce su Xist ad opera di molecole
        
        ci sono molti fattori coinvolti nella regolazione
        
        alcuni favoriscono o inibire l'espressione
        
        Il tutto si gioca sui fattori della pluripotenza che è giusto il momento del differenziamento cellulare quando avete
        
        Le cell con gli X attivi nella MCI le cell sono pluripotenti quando scatta il diferenziamneto che può succedere sia in vivo nell'embrione sia nelle cel stem in coltura
        
        Se nella Blastociti questi fattori sono espressi = Xist non è espresso e tt e 2 cromosomi sono attivi
        
        Nel momento in cui mettete i fattori di crescita perchè volete stimolarli al differenziamento
        
        Xa inizierà ad inattivarsi
- - - - Es_ Nella Blastocisti ad es, il gene espresso è quello materno,
        
        successivamente le cell germinali primordiali danno origine ai gameti
        
        ci sarà un 0 dell'informazione e un ripristino in modo tale che ci sia di nuovo un imprinting materno