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2.4 Virus & Procaryotes (Virus (Composants (Acides nucléique (ADN/ARN,…

- - - - Fumeurs noirs
      - Eaux polaires
      - Milieux anoxiques (panse ruminants)
      - Lagunes salées
      - .....
  - - - Ribosomes de forme diff
      - Compo de la paroi
        
        Gram +
        
        Pseudomuréine : un peu diff des petidoglycanes
        
        Gram -
        
        pas de membrane externe
        
        ouste muréine : bjr couche glycoprotéines
      - 1 Lipides membranaires particuliers
        
        [liaisons ether] et pas esther /e/ glycerol et acide gras
        
        font parfois des momocouches rigides avec ça
      - Introns ds les gènes
        
        introns ( parties non-codantes ds gènes, excisé avant traduct° en protéines)
  - - - pas de peptidoglycanes à bousiller
      - diff protéines ribosomiales
- - - - ADN/ARN, mono/dicatenaire... : DIVERSITE +++
    - - Protect° + accroche C et inject° matos gen
  - - - ex: patate
    - - svt insectes
    - - mosaique du tabac
  - - - Bactérie
      - Eucaryotes
  - - - milieux terrestres
      - milieux aquatiques
        
        stromatolithe
        
        trombolithe ( id strom ms sans cernes )
  - - - vecteurs ou pas
      - inject° matos gen ds C hôte
    - - product° virusss +++ : explosion C et libérat° des bébés virus
      - C encore vivantes ms dégenérescence : % incontrolées : verrue
      - Virus +- silencieux ( peu de copies)
- - - - Bactérie étudiées par microbiol classique
        mise en evi par :des cara morpho/physio métaboliques
        
        1) Crit morpho de déterminat°
        
        B.Forme
        
        :star: Bacilles
        :star: Mycélium: coloniaux
        :star: Vibrions : + flagelles
        :star: Coques ( groupes de )
        cfr p 154
        
        C. Groupement des C
        
        :star: châinettes
        :star: grappes
        :star: par deux
        
        A. Colo de Gram
        
        1) Une histoire de paroi...
        
        Gram +
        :check: paroi épaisse
        :pencil2: peptidoglycane : muréine
        
        Gram -
        :red_cross: paroi fine
        :recycle: + membrane ext lipidique
        
        Paroi ?
        :check: Protect° lyse osmotique
        :check: peptidoglycane =polymère cplx de glucose liés par polypeptides
        Image P155
        
        1 colore en bleu, décolore un peu, recolore en rose
        :silhouette: Bactérie ê bleu ? epaisse paroi petidoglycane
        :smiley: bact rose : gram - : petite membrane externe gaufrée attachée a la paroi de peptidoglycane
        
        2) Crit métaboliques
        
        a) production de l' E
        
        :<3: U quel Source de Carbone
        :<3: quel substrat
        :<3:Facteurs de croissances U ?
        
        b) rapport à l'environement
        
        :explode: rapport à l'O2
        :red_cross: Tolérances aux condit° environt
        :tada: produits fermentations ?
        
        c) Mise en évidence des critère métaboliques d'id ?
        
        Mise en culture: milieux définis/synthétique vs milieux complexe
        
        milieux cplx : extraits ou hydrolisats ( soja, caséine,...)
        facteures de croiss en prop variables
        
        :<3: culture large gamme de souche
        
        :check: bien si exigences pas cô /besoin milieux trop cplx a synth
        ex: bact du sang
        milieux sélectif:
        favo/inhibe bact particulières
        p/ex : Cellulose : selct° bact qui la digère
        toxines ...
        
        milieux déf/synth:
        :check: tt consti chim sont id
        qd :check: exigences d'une souche sont cô
    - - A) Quelle méthode
        
        1 Crit morpho/physio
        
        Bien pour ID
        Bof pour reflet phyllogénie : pb si perte secondaire de cara
        
        2 ADN :
        
        rapport des bases G, C/ A,T
        
        ARN
        
        Séquençage d'un gène d'ARN ribosomial particulier : ARN :<3: 16 S
        
        Conserve cara des parois et tient compte perte 2nd
      - B) les clades
        
        Protéobactéries = la maj des gram -
        
        photosynt : bactéries pourpes
        
        dérivant de parent photosynth < adpatées nouvelles niches
        
        Nitrobacter et Rhizobium (légumineuses) : fixatrice du N2
        
        Legionella
        
        Le super phyllum PVC
        Chlamidiés : perte secondaire paroi< devenues gram -
        
        srtt
        
        tuniques externes
        
        Les Terrabactéries
        srtt Gram +
        
        3.Cyanobactéries
        photosynth oxygéniques
        
        1. Firmicutes :
        Clostridium, Staph.... nasty !
        
        :green_cross: bases [G+C] faibles
        
        2.Actinomycètes/bact
        :red_flag: < Mycélium
        Actinomyces et Mycobacterium leprae Oo
        
        bases :green_cross: [G+C] fortes
        
        Thermes : paroi avec Ornithine ( AA)
        
        Chloroflexes: bact vertes non sulfureuses
        
        :red_cross: - d'espèces que les 3 autres
        
        Les autres
        cara distinctifs : séquences ARN 16 S diff
        ou cara de niches éco pas fiables pour taxonomie
        
        Spirochètes
        
        Gram -:warning: perte secondaire de la paroi
        = pb des homoplasies
        :recycle:flagelles particuliers
        :check: ok milieux visqueux
        ex : Borrellia et Treponème de la syphillis