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Virus&Bactériophage ET Bactérie pathogène (Virus (Production…
Virus&Bactériophage ET Bactérie pathogène
Virus
agent infectieux filtrable (Beijerink)
10nm à 1µm
Production
Organisation simple et non cellulaire
Absence ADN et ARN ensemble dans le même virion ( = particule virale )
Pas d'enzyme pour le métabolisme énergétique ou la synthèse des protéines
Incapacité à se multiplier sans cellule hôte. ATP et protéine produites par la cellules hôte
Particule virale
Non enveloppée
Hélicoïde ( L'acide nucléique est une longue molécule linéaire. Plusieurs copies de la protéine de capside enveloppent les acides nucléiques. Particules en forme de tige ou filamenteuses
Icosaèdre (capsules allant jusqu'à 20-30 nm de diamètre peuvent être formées avec 60 sous-unités identiques )
Les 2 : mixed
Enveloppée
Simple
Complexe
Purification
Ultracentrifugation en gradient du Saccharose ou CsCl2
Microscopie électronique ou SDS-PAGE ( comme PCR )
Génome : ADNdb, ADNmb, ARNdb, ARNmb
Bactériophage
Expérience de cycle lytique unique : si les bactéries sont lysées par le chloroforme, il est possible de quantifier uniquement les particules virales non infectées. -> Cycle lytique implique la multiplication des bactéries, et à la fin du cycle, les cellules sont détruites. Le cycle lysogénique est le cycle initial
Comptage d'un phage infectueux : ufp/mL (Unités de Formation de Plages)
Visualisation
Attachement(specific binding avec site d'attachement protéique du phage et récepteur bactérien ) et entrée visibles
Phase d'éclipse invisible : décapsidation, réplication et expression des gènes
Assemblée (recapsidation) et libération visibles
Transduction
Spécialisée
Réalisé uniquement par des phages tempérés ayant une lysogénie établie.
Seule une partie spécifique du génome bactérien est transférée.
Se produit lorsque le prophage est incorrectement excisé
Généralisée
Toute partie du génome bactérien peut être transférée
Se produit pendant le cycle lytique
Au cours de l'assemblage viral, des fragments d'ADN hôte ont été emballés par erreur dans la tête du phage
Postulat de Koch : Un agent est responsable de la maladie si 1. Il est retrouvé chez tous les malades 2. Il est retrouvé dans l'organe affecté par la maladie 3. Il est isolé des lésions de patients malades et maintenu en culture pure 4. La culture pure, inoculée à un volontaire (ou animal) sain entraîne les symptômes de la maladie 5. Le même agent doit être isolé en culture pure du patient infecté volontairement
Pathogenèse des maladies bactériennes
Infection : croissance et multiplication d’un parasite sur ou dans l'hôte
Maladie infectieuse : maladie résultant d'une infection
Agent pathogène : organisme parasitaire responsable d’une maladie infectieuse
Pathogénicité : capacité du parasite à provoquer la maladie.
Pour induire une maladie, une bactérie pathogène doit: Conserver un réservoir : endroit pour vivre avant et après avoir causé l'infection. • Transportée vers l'hôte et y entrer. • Adhérer, coloniser et/ou envahir l'hôte. • Echapper aux mécanismes de défense de l'hôte. • Se multiplier ou compléter des cycles de vie sur ou dans l'hôte. • Endommager l'hôte. • Quitter l'hôte et retourner au réservoir ou entrer dans un nouvel hôte
Voies de contamination et mode de transmission direct ou indirect
Respiratoire
Digestive
Cutanée
Transcutanée
Sexuelle
Pathogène
Stricte ou primaire : cause maladie chez un hôte sain par interaction directe
Opportuniste : fait partie de la flore normale et provoque une maladie lorsqu'il a accès à d'autres sites tissulaires ou que l'hôte est immunodéprimé
Infection et virulence
Virulence fait référence à la capacité d’une bactérie à provoquer une maladie. Elle reflète le nombre total des facteurs de virulence déterminés par le génome et exprimés dans l’hôte. Virulence est un indice du pouvoir d’un pathogène: capacité d’infecter l’hôte capacité de nuire à l’organisme-hôte
Infection = (Nb organisme x Virulence) / Résistance de l'hôte
Mesure virulence
Dose infectieuse DI50 : nombre de pathogènes qui infecteront 50% d'un groupe expérimental d'hôtes dans un délai spécifié
Dose létale DL50 : nombre de pathogènes qui tueront 50% d'un groupe expérimental d'hôtes dans un délai spécifié
Différentes souches de la même espèce bactérienne peuvent être plus ou moins virulentes
Gènes de virulences souvent portés par des plasmides -> ilots de pathogénicité(augmente la virulence microbienne). Non essentiel pour la bactérie, souvent organisé en opéron, portés sur des éléments d'ADN mobiles
Adhésion des bactéries aux cellules = début du processus de colonisation
Fimbriae = structures filiformes différentes des flagelles et des pilis ( prot d'adhésion )
Capsule ( glycocalix )
Ac. teichoïque et lipoteichoïque
Enzyme bactérien
Collagénase : dégrade collagène des tissus conjonctifs
Coagulase : protection contre les défenses de l'organismes par formation de caillos
Elastase : dissociation des membranes
Hyaluronidase : hydrolyse ac. hyaluronique et ciment inter-cell
Lécithinase : dégradation phosphatidylcholine membranaire
Streptokinase : digestion de la fibrine des caillots
Toxigénicité
Endotoxine : dans la cellule -> symptômes
Exotoxine : de la bactérie. Peuvent former un canal qui provoque la lyse de la cellule ou dégrade la membrane par exemple
Phagoyte produit ROS qui tue les bactéries
Le système de sécrétion de type III permet aux bactéries Gram négatif de sécréter et d'injecter via injectisome des protéines de virulence dans le cytoplasme d'un hôte eucaryote