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Intro et taxinomie microbienne (Histoire (1676 Van Leeuwenhoek : 1er…
Intro et taxinomie microbienne
Histoire
1676 Van Leeuwenhoek : 1er microscope et observation des animalcules
1798 Edward Jenner : 1ere vaccination contre la variole -> début de l'immunologie
1861 Louis Pasteur : met fin à la théorie des "générations spontanées" venant d'Aristote qui pense que la vie apparaît après la décomposition de matière non vivante. Pasteur démontre le contraire en prouvant que c'est la contamination de cette matière qui provoque la vie. Il découvre aussi la fermentation = vie sans oxygène
1867 Joseph Lister : méthode chirurgicale aseptique ( sans microorganisme), antiseptiques chimiques pour empêcher infection des plaies
1884 Robert Koch : isolement de culture pures ( pour éviter contamination ). 4 postulats pour identifier les bactéries infectieuses. Découverte des agents pathogènes pour chaque maladie infectieuse.
Cellule bactérienne
Organisation simple
100 millions de bactéries dans le corps humain : impacte notre comportement
Procaryotes (unicell, pas de mitochondries ni organites)
Eubacteria et Archea
Respiration par membrane cytoplasmique
Haploïde
Possède une paroi : muréine
Ribosome 70S
Virus de bactérie : bactériophage = pas de reproduction, toujours besoin d'une cellule hôte
Morphologie
Streptocoque (1µm)
Diplocoque
Staphylocoque
Bacille ( E.Coli )
Vibiocholera
Spirochète (1-250µm)
Taxinomie
Science de la classification biologique
Classificaation : arrangement des organismes en groupes ou taxons selon leurs similitudes ou parentés évolutives
Nomenclature
Identification : côté pratique consistant à déterminer qu'un isolant particulier appartient à un taxon connu
Différentes propriétés des cellules souches
Biovars : différence biochimique
sérovars : différence antigénique ( technique avec anticorps )
Toujours différentes par leur génotype mais pas forcément le phénotype
Numérique : Ssm = (a+d)/(a+b+c+d) -> Coeff de simple appariement (Matching)
Classification phylogénétique ( pour reconnaître procaryotes avec ARNr 16S ->PSU) par Charles Worse et Georges Fox 1977
Présente dans tous les microorganismes et assure la même fonction vitale, la synthèse des protéines
Molécule vitale et ainsi bien conservée au cours de l'évolution
Ne code pas une protéine et donc n'a pas de dégénérescence de codon
4.Séquence peut être déterminée à partir de l'ADN par PCR
Pas de mutation de type suppresseurs qui pourraient changer son expression
Signature oligonucléotidique = séquences nucléotidiques spécifiques différentes entre 16S et 18S ( eucaryotes )
Arbre -> La distance évolutive ED est calculée comme le pourcentage de différences de séquences observées entre les ARNr 16S d’organismes, pris deux par deux.
La valeur corrigée de ED est une correction statistique nécessaire tenant compte des mutations qui ont pu se produire au même site.