Établissement public à caractère administratif (EPA) depuis1926, l’organisation de la Bnuest encadrée par le décret n°92-45 du 15 janvier 1992[consulté le 8 mai 2020]portant sur l’organisation de la bibliothèque nationale et universitaire de Strasbourg. Ce décret conforte la tutelle du ministre chargé de l’enseignement supérieur sur la Bnu. Gérée par un administrateur, MrAlain Colas depuis le premier janvier 2016, son fonctionnement repose sur les délibérations du conseil d’administration. L’administrateur, nommé par décret ministériel, fait partie du corps scientifique des bibliothèques, prépare et exécute les décisions du conseil d’administration et encadre le personnel. Le conseil d’administration s’applique à définir et à évaluer la politique documentaire et à régler toutes les questions budgétaires. Il analyse les contrats et les conventions passées, rédige le rapport annuel d’activité et met en place le règlement intérieur