Please enable JavaScript.

Coggle requires JavaScript to display documents.

Comparación de tres métodos moleculares para el análisis de procariontes…

- - - - Se hicieron tres reacciones de PCR por separado
        
        Fragmentos Terminales de Restricción Polimórficos por Tamaño (T-RFLPs)
        
        Fundamento
        
        Reacción de restricción, para generar distintos fragmentos de ADN que componen un patrón característico (denominado “la huella” o fingerprint) de la comunidad analizada
        
        El tamaño de cada fragmento es considerado como equivalente a una unidad taxonómica operativa (OTU)
        
        Corresponden al sitio de restricción más cercano al oligonucleótido fluorescente que se utilizó en la reacción de PCR
        
        Oligonucleótido F515 marcado con fluorescencia VIC
        
        El producto obtenido por PCR (fragmento RNA) fue digerido enzimáticamente con Alu I
        
        Incubación en termociclador MJ Research
        
        Obtención de los tamaños y alturas de los FRT´s en forma de picos en un cromatograma
        
        Biblioteca de clones
        
        Mezcla de amplificados purificada se clonó en el vector plasmídico pCR2.1
        
        Aislamiento de plásmidos mediante kit de extracción
        
        Aquellos que contenían el inserto fueron secuenciados usando los oligonucleótidos M13F y M13R, en secuenciador ABI Avant 3100 PRISM®
        
        Secuencias revisadas en BioEdit para descarte de quimeras
        
        1 more item...
  - - - secuencias del gen 16S ADNr detectadas mediante rRNA-HMM
        
        Retención de aquellas mayores a 200 pb.
        
        Inspección para la detección de quimeras mediante Mallard
        
        Alineación y clasificación en Greengenes