Los ríos, lagos, embalses, pantanos y otros humedales aguas continentalesconstituyen lo que se denomina “aguas continentales, en otras palabras, son aquellas que se encuentren por encima o por debajo de la superficie terrestre, recorren a través de cauces y canales en la superficie terrestre y que son aprovechadas tanto para el abastecimiento de Agua Potable, la navegación, la obtención de Energía a través obras hidráulicas, sistemas de regadíos, la pesca y acuicultura. El istmo de Panamá cuenta con dos vertientes a los cuales drena corrientes de agua dulce, con cerca de 500 afluentes de los cuales se obtienen beneficios como los mencionados anteriormente.
Las aguas continentales recorren desde las cordilleras hasta las partes bajas, son las encargadas de arrastrar nutrientes, minerales y materiales que son llevados hasta la costa en sus diversas crecidas. Como dice la literatura el agua dulce que contiene el Planeta es muy poca, solo representa cerca de 3% del total de agua del Planeta. El agua dulce en el continente es el producto del ciclo hidrológico, el cual con las lluvias, produce vida a las plantas, brinda alimentos, nutre los acuíferos, se obtiene agua potable y da vida a miles de especies, satisfaciendo múltiples necesidades humanas. Panamá cuenta con largo y caudalosos ríos, como el Tuira Chucunaque, Changuinola, Río Bayano, Santa Maria, La Villa, Chiriquí Viejo, Chagres, con gran aporte de agua dulce, y que forma parte importante en el canal Interoceánico con el almacenamiento de agua dulce, sistemas de centrales eléctricas que abastecen de energía la economía nacional, Sistemas de riego como Remigio Rojas, el caño, igualmente las poblaciones circundante a estos ríos los utilizan para aseo diario, navegación y obtener proteínas. Peces como sábalo, sargento, tilapias, mojarras, pejeperro, sardinas, cocochas, Chogorros, Jurel y carpas son especies de ríos y lagos muy preferidos como alimentos; Igualmente los ríos son ricos en Macrobrachium Americanum o camarones, camarón azul, cangrejos y algunos moluscos se reproducen en el agua dulce, muchos de esto son migratorios para su reproducción aguas salobres. Es por ello que las infraestructuras que bloquean el curso de los ríos deben establecer un estructura para permitir que estas especies migratorias puedan completar su ciclo reproductivo, ya sea aguas arriba o aguas abajo.