Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
SEQUENCIAMENTO DE SANGER E DESENHO DE PRIMERS - Coggle Diagram
SEQUENCIAMENTO DE SANGER E DESENHO DE PRIMERS
produz reads com tamanho de até 1000 nt
700-750 são mais comuns
método desenvolvido por Frederick Sanger
consiste na síntese de cadeias a partir de fragmentos de DNA
as cadeias são marcadas por fluoróforos
uso de ddNTPs
resulta em uma cadeia truncada
uso de eletroforese
separa as cadeias truncadas
é possível estabelecer a sequência dede nucleotídeos do fragmento de DNA original
PHRED SCORE
escore de qualidade do sequenciamento
Trimagem
exclusão de determinada região da sequência que acumula nucleotídeos sequenciados com escores abaixo de um determinado valor
pode ser usado para remover outras regiões indesejáveis
sequência de vetores, adaptadores...
Softwares que podem ser utilizados para análises dos dados
Unipro UGENE
Phred
Biopython SeqIO