A prevalência de criptorquidia varia geograficamente. Em um estudo de coorte prospectivo, a criptorquidia estava presente em 9 por cento (IC 95% 7,3-10,8) dos meninos recém-nascidos na Dinamarca, mas apenas 2,4 por cento (IC 95% 1,7-3,3) dos meninos recém-nascidos na Finlândia.
Não está claro se essa variação é devida a fatores genéticos ou ambientais (por exemplo, produtos químicos desreguladores do sistema endócrino, fatores de estilo de vida) ou a definição clínica de testículo não descido versus retrátil.