Sendo assim, temos, dentro da deficiência de cobalamina, manifestações hematológicas, digestivas e neurológicas. As hematológicas são as comuns a todas as anemias, ou seja, astenia, palpitação, cefaleia, irritabilidade, e petéquias e púrpuras devido a trombocitopenia.
As digestivas, secundárias à má absorção, são diarreia e perda de peso
Por último, as manifestações neurológicas estão associadas a ausência de uma reação da vitamina, provocando o acúmulo de ácido metilmalônico e a formação inadequada de metionina (importante para a formação da bainha de mielina).