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Transcrição em Eucariotos - Coggle Diagram
Transcrição em Eucariotos
Transcrição
:
RNAPII
Fases
Alongamento:
incorporação de ribonucleotídeos
Possibilidade de pausa! Acelera e para de acordo com a necessidade da célula
Essas pausas são determinadas por (1) fosforilações e desfosforilações de Serinas! na cauda CTD da RNAPII e (2) isomerizações das prolinas
Essas modificações pós traducionais feitas na molécula de RNA da RNAPII irão determinar o quão rápida ela é ou não na sua síntese
Ocorre então fosforilação da Ser2 da cauda CTD, que é o sinal de que a síntese deve ser
terminada!
Terminação:
sequências específicas indicam que a síntese deve ser interropmida: acontece de forma distinta, depende da RNAP
Início:
reconhecimento das regiões NFR (livres de nucleossomos) na sequência do promotor do DNA
Estrutura de
promotores focalizados da RNA Pol II
Regiões
regulatórias
Promotor principal: Responsável por manter as condições
basais
de expressão
Inr: Iniciador (-2 a +5)
TATA box upstream (a esquerda do gene)
TATAless downstream
Reconhecidos por
fatores de transcrição!
Universal: proteína TBP TATA biding protein
Específicos
Basal
RNA pol II + TF = PIC
(complexo mínimo necessário para iniciar a transcrição) - RNAP e TF necessitam
se ligar
a região promotora!
1) TBP + TAFs (fatores acossidados a TBP) = TFIID: se ligam a TATA box ou TATAless, depende do gene
2) Após a ligação dos
TFIID
, os
TFIIA
se ligarão e deslocarão uma das TAFs do TFIID: isso ocorre porque quando o TFIID se liga a molécula de DNA ele adentra na dupla fita, sem promover a quebra da PH, mas se fixa! e para que isso aconteça a TFIIA precisa tirar a TAF1, então o TFIID se liga ao DNA de forma mais firme
3) A
TFIIB
ajuda a estabilizar esta ligação, do TFIID a molécula de DNA, e
recruta a RNAPII
4) Chega na molécula de DNA a RNAPII, carregada pelo
TFIIF
5)
TFIIE
: tem ação ATPase e Helicase, ajudando a abrir o DNA
6)
TFIIH:
helicase e quinase (forsforila Serina 5 da região C terminal da RNAPII e recruta mecanismos de reparo, que auxiliam para que a transcrição ocorra de forma correta)
Essa fosforilação determina o início da síntese de transcrição, alé de recrutar a guanil transferase e o complexo PAF (necessário para que haja a modificação das histonas)
Acontece então a iniciação abortiva, o que leva a uma alteração conformacional da TFIIB. Quando isso ocorrer, a iniciação abortiva será perdida, pois a RNAPII consegue agora percorrer a molécula de DNA (escapa do promotor)
1 more item...
7) Alguns genes ainda contam com
enhances
- proteínas (TF) que reconhecem porções mais longe da região codificadora. Porções que estão upstream da molécula.
Função dos
enhancers
é garantir que o complexo permaneça ligado naquela região promotora, porque é um gene que precisa ser transcrito muitas vezes
Ocorre no
núcleo
, onde o RNA sofre processamento antes de migrar para o citosol
Formação de híbridos
RNA:DNA
: RNA é complementar a uma das fitas de DNA e por ser complementar ele poderia se ligar a fita de DNA, impedindo que a outra fita de ligasse a ele. Para impedir a formação desse híbrido
Na medida em que o RNA está sendo sintetizado, a cauda CTD da RNAPII é fosforilada e imediatamente inicia o processo de inclusão de proteínas nesse mRNA
Se mesmo assim isso acontecer:
Ação da RNAse H que irá desfazer a ligação
Ligação permanece e quando a molécula de DNA for replicada, nessa fase vai haver a dissolução do mRNA
Transcrição: RNAPI e RNAPIII
RNAPIII
Reconhece o promotor na região +1 (região inicial de transcrição) e todo promotor desses genes se encontram a downstream da sequência
(1) reconhecimento da RNAPIII, (2) TFIIIB (também contém TBP), (3) TFIIIC e (4) TFIIIA
RANPI
Promotor core
Depende da ligação da proteína
SL1
, e tem a porção TBP também
UPE
(elemento de promotor upstream): região upstream
Aqui se liga a proteína
UBF
, que é resposável por liberar a RNAP do promotor no momento em que deve começar a síntese
(1) SL1 se liga ao promotor, (2) UBF se liga na UPE e a RNAPI começa a síntetizar
Estrutura de um gene eucariótico
Promotor
Dispersos
Depende de sequências dispersas ao longo de uma sequência maior do DNA (50-100nt)
Ilhas CpG
Regulam os genes constitutivos - housekeeping (expressão se mantém relativamente constante ao longo do tempo)
Focalizados
Regulam os genes regulados (aumenta ou reduz a expressão de genes através de sinalização de proteínas reguladoras)
Região codificadora
íntros: excisados do mRNA maduro
Éxons: permanecem na sequência do mRNA maduro
Sítio de PoliA
RNA polimerase:
necessitam do auxilio de proteínas auxiliares (fatores de transcrição)! não atuam sozinhas
RNA pol I (50-70%)
Nuclear
Confecção de rRNAs
RNA pol II (20-40%)
Nuclear
hnRNA (heterogênios nucleares - mRNA antes de sofrer processamento )
snRNA (nucleares pequenos)
RNA pol III (10%)
Nucleo
rRNA 5S
tRNAS
snRNAs
snoRNAs
RNA pol Mitocondrial: como em procariotos
RNA pol Cloroplastos: como em procariotos
Terminação
RNAPII
Alostérico: clivagem do DNA pelo complexo de poliadenilação
Torpedo: ação de exonucleases
RNAPIII
Sequências ricas em T: desestabilização!
RNAPI