При вроджених незрощеннях губи та піднебіння порушена неперервність ротового жому, піднебіння скорочене, середня частина глотки розширена, м’язи глоткового кільця недорозвинені, порожнина рота сполучається з порожниною носа. Ці анатомічні порушення викликають функціональні розлади акту ссання, дихання та звукоутворення.
Вроджене незрощення верхньої губи та піднебіння є одним з несприятливих факторів, які впливають на незміцнілий організм дитини. Висока захворюваність, за даними різних авторів, підвищується з віком дитини та зумовлює несприятливий соматичний стан у спостережуваних дітей у 14% випадків, що призводить до необхідності відкладання оперативного втручання до часу ліквідації осередків запального чи дистрофічного характеру.