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11_Network_biology - Coggle Diagram

- - - - Random networks
        
        most nodes have similar number of connections
        
        distribuzione del grado normale, abbiamo un grado caratteristico per i nodi
      - Scale free networks
        
        most nodes have only one connection
        
        pochi nodi sono molto connessi
        
        distribuzione : esponenziale, quindi in scala logaritmica è una linea
        
        la maggior parte dei sistemi biologici sono così
    - - mode of the degree distribution
- - - - I “motivi di rete” sono quei pattern per i quali la probabilità P di apparire in una rete randomizzata un numero di volte uguale o maggiore rispetto alla rete reale è inferiore a un valore di cutoff
  - - - è definito come lo strato di interazione sovrapposta e un gruppo di fattori di trascrizione dell'input.
      - Un insieme di geni controllati da un insieme di fattori di trascrizione.
    - - version semplice di DOR
      - due regolatori di trascrizione si legano a un obiettivo comune.
    - - un regolatore che controlla altri due regolatori che regolano ulteriormente un gene.
    - - Fattore di trascrizione singolo che regola molti targets, e anche se stesso
    - - tre entità sono regolate l'una dall'altra in maniera asimmetrica per controllare un dato processo biologico
- - - - protein
  - - - geni
      - proteine