En cromatografía de gases se usan dos tipos generales de columnas, las rellenas, y las abiertas o capilares. Hasta la fecha la mayor parte de las cromatografía de gases se ha realizado con columnas rellenas. Sin embargo, en la actualidad esta situación está cambiando rápidamente y parece probable que en un futuro próximo,excepto para ciertas aplicaciones especiales, las columnas de relleno sean sustituidas por columnas abiertas más eficaces y rápidas. Las columnas cromatográficas varían desde menos de 2 hasta 50m de longitud o más. Están construidas con acero inoxidable, vidrio, sílice fundida o teflón.