Nos períodos anteriores da República, ao menos como plano de governo, figurava o programa de integração nacional dos grupos indígenas. Durante o período da Ditadura Civil-Militar, esse programa foi abandonado. O Serviço de Proteção ao Índio (SPI) deu lugar à Fundação Nacional do Índio (Funai), em 1967. O órgão ain-da tinha a missão de proteger os grupos indígenas, mas na prática servia aos interesses do governo, barrando representações organizadas pelos próprios indígenas. O uso da força contra a resistência indígena à apropriação de suas terras pelo governo ocorreu em diversos locais do país. Podemos citar como exemplo a quase completa eliminação dos Waimiri-Atroari por integrantes do Exército brasileiro para a construção da BR-174, que liga Manaus a Boa Vista. A comunidade Waimiri-Atroari, que na década de 1970 contava com cerca de 3 mil integrantes, na década de 1980 estava reduzida a 332 indígenas.Os indígenas não aceitaram tal condição passivamente. Com o auxílio de ONGs, da Ordem dos Advogados do Brasil (OAB), de setores da Igreja e de lideranças indígenas, promoveram assembleias. A finalidade delas era discutir questões de interesse desses povos, com destaque para a demarcação de terras.