La diferència entre uns i altres és que els sistemes són conjunts d'òrgans molt similars en forma i en funció repartits per tot l'organisme (exemples: sistema nerviós, sistemaesquelètic, sistema muscular) i els aparells són conjunts d'òrgans localitzats en una zona determinada, que poden ser molt diferents en quant a forma, però que col·laboren en una mateixa funció (exemples: aparell digestiu, aparell respiratori, aparell reproductor).