Arquitectónicamente hablando, casi todas las iglesias tienen una planta en forma de algún tipo de cruz en relación con la nave central. También, la mayoría de las naves centrales tienen, a cada lado, una nave secundaria. En el caso de la iglesia La Merced, la cruz es llamada latina. Los interiores del templo son modestos y se destaca un techo soportado por columnas gigantes que descansan sobre un pedestal. Las imágenes más reverenciadas por los fieles son la Virgen de la Merced, obviamente, y Jesús Nazareno.