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Immunità innata e intrinseca (Immunità intrinseca (Apoptosi (Segnale…
Immunità innata e intrinseca
Risposta innata vertebrati
Interferoni
Citochine secrete
3 tipi
IFN I
IFNα
IFNβ
IFN II
IFNγ
Coinvolto nella risposta adattativa
IFN III
IFNλ
Secreto da cellule fegato
IFN
Cellula rileva patogeno
Recettori PRR, pattern recognition receptors
Riconoscono PAMP, pathogen associated molecular patterns
Un PAMP è dsRNA che si produce in infezione virale
PRR lega PAMP e si lega ad adattatori
Ad ogni adattatore corrisponde cascata di segnali diversa
Si attivano fattori di trascrizione
IRF3
Attivazione trascrizione gene per IFNβ insieme a NFkB
NFkB
Attiva promotori di geni proinfiammatori
IFNβ
Viene secreto fuori dalle cellule
Si lega a recettore JAK α/β di membrana di cellula che lo ha prodotto e cellule vicine. JAK si fosforila, attiva fattori STAT
STAT sono fattori trascrizione attivano ISG, IFN stimulated genes
Porta anche a secrezione di IFNα che amplifica risposta
Uno dei prodotti è PKR, protein chinasi R; PKR lega dsRNA e blocca fattore d'inizio eIF2α, fosforilandolo = impedisce traduz.
Doppio controllo di PKR: attivata prima da IFN e poi da dsRNA
Contromisure dei virus contro immunità innata
Adenovirus
RNA VAI
Bloccano PKR facendo da "esca" e legandola irreversibilmente
Paramixovirus
Proteine V
Bloccano INFβ e attivazione geni ISG
Poliubiquitinazione proteine ospite le porta a degradazione con proteasoma
Proteine che alterano PML bodies coinvolti nell'azione degli interferoni
Capacità virus di neutralizzare difese è specie specifica, se cambio ospite non funziona
Nei mammiferi
Proteine TRIM
Molte sono indotte da IFN I
TRIM5α limita spoliazione HIV
Molte sono ubiquitina ligasi E3, molti substrati differenti che vengono indirizzati a degradazione
Immunità intrinseca
Caratteristiche ospite
Precedentemente a infezione
Fattori di immunità intrinseca incrementati da IFN
Limitano replicazione virale in modo specifico
Autofagia
Materiale cellulare inglobato in autofagosoma che si fonde con lisosoma
Segnale
Esposizione al citoplasma di lipidi normalmente sulla parte esterna della membrana in quanto con l'endocitosi virale si trovano sulla parte interna delle vescicole
Virus rivestiti non rompono la vescicola, virus senza envelope si, innescano autofagia
Apoptosi
Cellula che muore non si rompe, contenuto resta all'interno
Cellule morte eliminate da fagociti
Segnale
Proteine virali, blocco espressione genica cellulare
Serve perché sopravvivenza cellula infettata è rischio per intero organismo
Alcuni virus bloccano segnali apoptotici
Virus si evolvono più rapidamente degli ospiti: sono sempre un passo più avanti alla risposta innata o intrinseca
Via RNAi
In piante e invertebrati
dsRNA virale riconosciuto da Dicer2 che lo rompe in oligonucleotidi
Associazione con proteina argonauta
Doppia elica srotolata, filamento singolo caricato nel complesso di silenziamento (RISC)
RISC si lega all'RNA virale degradandolo
Piante e invertebrati hanno sistemi di rilevazione infezione simili a vertebrati
Nei batteri e archaea
Sistema CRISPR
"Library", include sequenze DNA (e RNA) di virus che ha incontrato
Struttura: DNA- spacer - DNA - spacer...
Più è lungo più virus ha incontrato
Ogni tot si produce RNA dal CRISPR che viene poi frammentato (maturazione) e se trova DNA virale complementare ci si appaia bloccandolo
Proteine CAS associate al CRISPR riconoscono DNA esogeni, li tagliano e li inseriscono nel CRISPR