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Translation 密碼子與反密碼子 (概論 (問題思考 (tRNA如何與胺基酸配對?, tRNA如何與胺基酸配對?, 如何催化肽鍵ㄉ形成?,…

- - - - 形成方式
        
        分子內氫鍵
      - three loop
        
        重點:anticodon loop
        
        有anticodon
        
        anticodon與mRNA上的序列互補。
        
        D loop
        
        易斷裂的片段
        
        易更換鹼基對
        
        TwC loop
        
        易斷裂的片段
        
        易更換鹼基對
      - acceptor stem
        
        3端接上胺基酸
        
        固定序列: 5'...CCA--OH 3'
      - variable loop
        
        不同處
        
        鹼基成分
        
        長度
    - - 每一種密碼子，對應一種胺基酸；每一種胺基酸對應一種tRNA；但每一種tRNA可以對應不只一種密碼子。
      - tRNA對胺基酸的專一性來自用來活化胺基酸的酵素對胺基酸的專一性
      - aminoacyl-tRNA synthetase #
        
        用來活化胺基酸的酵素
    - - 時機
        
        轉錄後修飾
  - - - 活化胺基酸，使胺基酸接到tRNA上
    - - 水解1 ATP。
  - - - mRNA的讀取方向: 5端-->3端
    - - 蛋白質的生成方向: N端-->C端。
- - - - 表示前一組密碼子與下一組密碼子間不會共用核甘酸；即不會出現只有5個核甘酸，卻代表了2個密碼子的情形。
    - - 表示前一個密碼子與下一組密碼子中間不會插入一個或數個非密碼的核甘酸。
    - - 指「一種氨基酸可以對應一或數種密碼子」的現象。
    - - 指「一種氨基酸可以對應一或數種密碼子」的現象。
    - - 指「會轉譯出胺基酸」的密碼子。
    - - 指「不會轉譯出胺基酸」的密碼子。
        
        三個終止密碼子就是因為沒有可以對應的tRNA所以轉譯碰到這三個密碼子就會停止。
  - - - 第21種胺基酸(Sec)
        
        tRNAsec
        
        tRNA會攜帶Ser，但接到肽鏈上會變成Sec
        
        SECIS (Sec Insertion Sequence)
        
        用來轉譯胺基酸而非終止反應，在密碼子前應要在 3-untranslated region (3'UTR) 插入一段序列稱 SECIS (Sec Insertion Sequence)
      - 第22種氨基酸(Pyl)
        
        有自己的tRNA；
      - 蛋白質中Met的比例遠高於細胞中其他位置的蛋白質
  - - - 單一鹼基的substitution mutations是最常見的自發性突變反應。
    - - 例子
        
        Proflavin
  - - - Watson-Crick rule
        
        密碼子與反密碼子在第一碼和第二碼都是使用Watson-Crick rule進行鹼基配對。
      - wobble rule
        
        密碼子的第三碼所使用的鹼基配對原則
        
        課本有此法的配對規則表
        
        有時是用Watson-Crick rule，
        
        有時是用wobble rule。
    - - 第一個AUG便作為起始密碼子；之後碰到的所有AUG都用來轉譯Met。
    - - 因為沒有可專一配對的反密碼子tRNA存在，所以可以終止轉譯。