Tra i protozoi più pericolosi vi è il plasmodio della malaria. Oltre ai funghi commestibili ci sono anche quelli velenosi, come l'amanita falloide, che producono sostanze nocive, le micotossine, responsabili di intossicazioni talvolta letali. Altri funghi sono responsabili di infezioni, dette micosi, annidandosi tra i capelli, le dita dei piedi e sotto leunghie.