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Biological network extraction from Scientific literature: state of the art…
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signaling and metabolic pathway本质上是network, signaling pathway关于细胞信息的传递,而metabolic pathway关于的是能量如何进入cell,如何为细胞供能。
老师:relation代表哪两个entity有关系,而event则更加具体,包含了directionality, polarity等信息,一个event包含一个relation
这部分的主要内容是介绍bio中event extraction的三种方法,co-occurrence, pattern-based, machine learning. 事实上,这部分内容的介绍仅仅是浅尝辄止,读过之后剩下的也只是:嗯,知道有这么三个方法了,对于这些方法具体是什么,具体又在bio中有何应用,就需要学习NLP的知识,阅读这三种方法state of art的文献,以及在bio中应用的state of art的文献。
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