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Culturomics (Ventajas (Detecta microorganismos "no cultivables",…
Culturomics
Ventajas
Detecta microorganismos "no cultivables"
Detecta poblaciones minoritarias
Enfoque abierto
Sólo detecta bacterias viables
Rowbotham
desarrola un
enfoque con capacidad de
cultivar selectivamente microorganismos resistentes a amebas
Cocultivo Amoebal (método de cultivo celular utilizado en
amebas)
inventó la culturómica
demostró que este nuevo enfoque es factible
Metodología
Pirosecuenciación de amplicones de rRNA 16S
metagenómica directa
identificación MALDI-TOF MS
Tracto intestinal humano
tiene
potencial
para detectar poblaciones minoritarias
cepas
permiten una ampliación e interacciones entre diferentes cepas
No solo a eubacterias
Definición
Método que permite la descripción de lo microbiano
composición por secuenciación de alto rendimiento
lo propone
Lagier como un complemento ideal
de enfoque metagenómico
debido
a la capacidad de aumentar
el repertorio microbiano