A principal limitação na utilização dos AINEs são seus efeitos gastrointestinais que estão entre os mais graves, incluindo náuseas, dor abdominal e úlcera gástrica.Os AINEs inibidores seletivos de COX-2 parecem minimizar esses efeitos.Os AINEs não oferecem efeitos cardioprotetores, e podem agravar problemas renais em pacientes idosos, com insuficiência cardíaca, diabéticos, cirróticos, dentre outros.