Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
Biokemi (METABOLISM (CELLANDNING:
av mat och syre bildas CO2, H2O,…
Biokemi
METABOLISM
Anabolism: uppbyggnad av molekyler, kräver energi
bildar makromolekyler av a-syror, socker, kväveföreningar
Katabolism: nedbrytning av kolhydrater, fett, proteiner, energi frigörs
ATP:
- kräver energi för att bildas, energi frigörs när fosfatgruppen binder till ANNAN molekyl.
- Transportör mellan kata och ana
- produktion i mitokondrier
-
CELLANDNING:
av mat och syre bildas CO2, H2O, energi
Citronsyracykeln: från acetyl-CoA
- i mitokondrien
- ATP frigörs
- 2 CO2 frigörs
Andningskedjan:
- syre: elektrontagare, blir till vatten
- energinivån sjunker
- energin blir mest värme/bilda H2O
- i inre mitokondriemembranet
- NADH bär elektroner från steg 1 och 2- hänger ihop
- elektrontransport sker genom
Pyruvat till Acetyl-CoA, i mitokondrie, glykolys och citronsyracykeln kopplas ihop
Glykolysen: (före kolhydrater till glukos)
- glukos till pyruvat
- förbrukar och bildar ATP, totalt mer bildade
- energi frigörs (även via NADH)
- i cytoplasman
Skillnad i konc av vätejoner inne och ute membranet, leder till att H+ strömmar in genom enzymet ATP-syntas som får plattor att rotera och tvingar ADP till ATP
-
Lipider
- svårlösliga i vatten
- ur organiskt material.
- i cellmembran, könshormoner
Fett:
- tillräckligt lång kolkedja, helt hydrofob,
Mättat:
- rakare, större chans till interaktioner, lägre smältpunkts. liknar t.ex. hormoner
Omättat:
- Cis: H på samma sida om dubbelbindn, bulkigare form. lägre smältpunkt
- Trans: olika sidor om dubbelbindn, rak
liknar mättat fett, större chans till interaktioner, liknar hormoner
- BÅDA formerna finns i omättat, det är formen som är farlig
Fosfolipider: fosfatgrupp, hydrofil
Kolhydrater
- energibärare
- energilager
- kolkälla
- strukturelement
mest D-varianter i natuen
- typ hydrofila
Monosackarider:
trios, pentos osv. glukos är en hexos. cyklisk struktur
Ofta FOSFORYLERADE, ger stor energi
Poly/oligosackarider:
flera mono. Glykosidbindning (acetalbindning) mellan
Stärkelse, glykogen, cellulosa stabilare, ej nedbrytningsbar
Proteinrening
Gelfiltrering
- störst går först
- skillnader i molekylstorlek
- tillräcklig små i kornen
- stora åker ut med lösningen
Elektrofores
- vandrar i elektriskt fält
- proteiner har olika laddning
- vandringshastighet laddning/storlek/form
Affinitetskromatografi
- affinitetsgel: stödfas+likt substrat
- unyttjas att proteinet binder till specifikt substrat
- för att få ut tillsätts riktigt substrat
Röntgendiffraktion
- bestämma rymdstrukturen
- kristalliseras
- strålning reflekteras- mönster
Jonbyteskromatografi:
- kolonn med laddad stödfas
- laddade proteiner binder till sidan
- salt eller ph-lösning hälls på-- utkonkurrerar eller gör grupperna oladdade
- faller ut i ordning som bestäms av isoelektrisk punkt
Proteiner:
Struktur: antar struktur spontant, det läget med lägst energi, hydrofoba effekten
-
Tertiärstruktur:
total rymdstruktur
avgör därför proteinets funktion (aktivt centrum)
stabiliseras av väte- jonbidningar och vdW
-
-
Aminosyror:
peptidbindingar (O--C-N-H) sinsemellan. stabil-ett plan-delokaliserade e Kondensationsreaktion (H2O)
-
Två sorter:
Fibrösa: hår, hud, naglar olösliga
Globulära: enzymer, antikroppar lösliga
Enzymer: specifika, effektiva, reglerbara. aktivt centrum, specifikt substrat. co-faktor- vitaminer
sänker aktiveringsenergin utan att sjävla förbrukas
-
Genetisk information:
-
RNA:
- EN kedja
- Uracil (ej T)
- Ribos
mRNA: messenger
- info om aminosyrasekvens för polypeptidkedja till ribosomer
rRNA: ribosomal
- tillsammans med proteiner som bygger upp ribosomerna
tRNA: transfer
- klöverbladsstruktur
- transport av aminosyror vid proteinsyntes
- ovanliga baser
Transgena organismer:
Restriktionsenzymer:
- kan bryta DNA-kedja, klippa ut bestämd del
- Klibbiga ändar
- Trubbiga ändar*
PCR-metoden: odla DNA-sekvenser
- enzym från bakterie som replikerar DNA
-
-
För att flytta gen:
- vektor (virus/plasmid) - överför genen till organismen
Kloning:
- identifiera gen för protein
- restriktionsenzym klipper ut
- sätts in i plasmid
- odla bakterie-> producera protein