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BIOCHIMIE G.(Dotto) (Protéines (résultat traduction ADN) (Structures &…
BIOCHIMIE G.(Dotto)
Protéines (résultat traduction ADN)
Structures & fonctions
Acides aminés (20aa)
Structure
Bloc monomérique prot.
C central liés à 4 g.diff.
Amine (NH2)
Carboxyl (COOH)
H
R
Ionisation varie selon pH
pH neutre : zwitterions
pKa < 4 : Acide : COOH, NH3 +
pKa NH3 > 7 : Basique : COO-, NH2
His + Cys --> état ionisé flexible à pH physiologique. Liaisons ionique + donner ou accepter p+ (faciliter réels.enzymatiques)
3 groupes
Hydrophobes
R latérales hydrocarbures linéaires : Ala, Val, leu, Ile, Met (atom.S)
R latérales aromatiques : aa : Phe & Trp
Tyr : R latéral hydrophobes mais gr. OH HYDROPHILE
Hydrophile
chargé + : arg, lys, his :warning: histidine + (protons) mais - aussi car pH : 7.4
chargé - : asp, glu, gr. COO- pKa<pH
+/- : asn, gln (carbamides, C=O)
Hydroxylated :warning: Ser + Thr + Tyr* : Gr OH
Spécial
CYS / GLY / PRO
:warning: Cyst : Gr. SH --> pt. sulfure avec autre ces de mê prot ou voisine// Glycne -R--> H // Proline coude bcs lia.NH //
Struct. 1 : protéine : séquence spécifique aa, caract. directionnalité : NH2 N-terminus et COO- au C-terminus
liaison entre aa résultent déshydratation = Liaison peptidique
Squelette = Ensemble liaison peptidique répétées entre différents aa
structure résonance (liai. simple ou double entre C-O ou C-N)
Struct 2. :replient localisé partie spécifiques d'un polypetide
Alpha hélice : Liaison H entre CO et H amide vers C terminus // R dir. extérieur hélice
hydrophobes
Hydrophile
Amphipatique (hydrophile+phobes)
Beta feuillet : 5-6 aa regroupé latéralement, liaison H entre O et NH squelette brins voisins
Tour-U
Structure ''en boucle''
Struc.3 & motif de structure
Struc. 4 : les globines
Structures mutimériques & assemblages macromoléculaires
Monomériques --> déshydratation --> macromolécules (l.covalentes)
Protéines fonctionnelles
Fonction d'une protéine dérive de sa 3D, qui elle découle de structure primaire, qui elle est déterminée à partir de la séquence ADN gène correspondant.
Synthèse
Peptide : 20-30 aa Plolypetitde : 4000aa Protéine : polypeptide ou plus polypetides assemblés structure 3D définie Protéome : complexe de toute protéine exprimé dans organisme
113 Da (masse moyenne aa MW)
Lipides
Principes de la transduction du signal